Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SacsQ9JLC8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SacsQ9JLC8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SacsQ9JLC8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SacsQ9JLC8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SacsQ9JLC8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SacsQ9JLC8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SacsQ9JLC8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SacsQ9JLC8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SacsQ9JLC8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SacsQ9JLC8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SacsQ9JLC8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SacsQ9JLC8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SacsQ9JLC8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SacsQ9JLC8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SacsQ9JLC8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SacsQ9JLC8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SacsQ9JLC8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SacsQ9JLC8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SacsQ9JLC8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SacsQ9JLC8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SacsQ9JLC8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SacsQ9JLC8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SacsQ9JLC8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SacsQ9JLC8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SacsQ9JLC8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SacsQ9JLC8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SacsQ9JLC8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SacsQ9JLC8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SacsQ9JLC8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SacsQ9JLC8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SacsQ9JLC8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SacsQ9JLC8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SacsQ9JLC8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SacsQ9JLC8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SacsQ9JLC8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SacsQ9JLC8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SacsQ9JLC8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SacsQ9JLC8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SacsQ9JLC8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SacsQ9JLC8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SacsQ9JLC8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SacsQ9JLC8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SacsQ9JLC8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SacsQ9JLC8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SacsQ9JLC8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SacsQ9JLC8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SacsQ9JLC8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SacsQ9JLC8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SacsQ9JLC8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SacsQ9JLC8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SacsQ9JLC8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SacsQ9JLC8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SacsQ9JLC8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SacsQ9JLC8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SacsQ9JLC8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SacsQ9JLC8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SacsQ9JLC8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SacsQ9JLC8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SacsQ9JLC8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SacsQ9JLC8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SacsQ9JLC8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SacsQ9JLC8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SacsQ9JLC8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SacsQ9JLC8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SacsQ9JLC8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SacsQ9JLC8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SacsQ9JLC8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SacsQ9JLC8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SacsQ9JLC8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SacsQ9JLC8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SacsQ9JLC8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SacsQ9JLC8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SacsQ9JLC8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SacsQ9JLC8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SacsQ9JLC8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SacsQ9JLC8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SacsQ9JLC8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SacsQ9JLC8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SacsQ9JLC8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SacsQ9JLC8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SacsQ9JLC8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SacsQ9JLC8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SacsQ9JLC8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SacsQ9JLC8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SacsQ9JLC8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SacsQ9JLC8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SacsQ9JLC8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SacsQ9JLC8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SacsQ9JLC8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SacsQ9JLC8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SacsQ9JLC8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SacsQ9JLC8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SacsQ9JLC8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SacsQ9JLC8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SacsQ9JLC8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SacsQ9JLC8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SacsQ9JLC8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SacsQ9JLC8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SacsQ9JLC8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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