Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Vpreb3D3Z6J4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21,01■□□□□ 0,95
Vpreb3D3Z6J4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Vpreb3D3Z6J4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Vpreb3D3Z6J4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20,02■□□□□ 0,79
Vpreb3D3Z6J4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Vpreb3D3Z6J4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Vpreb3D3Z6J4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
Vpreb3D3Z6J4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19,36■□□□□ 0,69
Vpreb3D3Z6J4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,23■□□□□ 0,67
Vpreb3D3Z6J4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
Vpreb3D3Z6J4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Vpreb3D3Z6J4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Vpreb3D3Z6J4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Vpreb3D3Z6J4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Vpreb3D3Z6J4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
Vpreb3D3Z6J4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC19,01■□□□□ 0,63
Vpreb3D3Z6J4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Vpreb3D3Z6J4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC18,97■□□□□ 0,63
Vpreb3D3Z6J4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Vpreb3D3Z6J4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Vpreb3D3Z6J4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Vpreb3D3Z6J4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Vpreb3D3Z6J4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC18,65■□□□□ 0,58
Vpreb3D3Z6J4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,62■□□□□ 0,57
Vpreb3D3Z6J4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18,53■□□□□ 0,56
Vpreb3D3Z6J4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,52■□□□□ 0,56
Vpreb3D3Z6J4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,49■□□□□ 0,55
Vpreb3D3Z6J4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC18,48■□□□□ 0,55
Vpreb3D3Z6J4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,45■□□□□ 0,54
Vpreb3D3Z6J4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,4■□□□□ 0,54
Vpreb3D3Z6J4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,38■□□□□ 0,53
Vpreb3D3Z6J4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
Vpreb3D3Z6J4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18,35■□□□□ 0,53
Vpreb3D3Z6J4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,34■□□□□ 0,53
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18,32■□□□□ 0,52
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
Vpreb3D3Z6J4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC18,28■□□□□ 0,52
Vpreb3D3Z6J4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,26■□□□□ 0,51
Vpreb3D3Z6J4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Vpreb3D3Z6J4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Vpreb3D3Z6J4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18,15■□□□□ 0,5
Vpreb3D3Z6J4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Vpreb3D3Z6J4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,48
Vpreb3D3Z6J4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Vpreb3D3Z6J4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18,02■□□□□ 0,48
Vpreb3D3Z6J4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Vpreb3D3Z6J4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC17,97■□□□□ 0,47
Vpreb3D3Z6J4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17,93■□□□□ 0,46
Vpreb3D3Z6J4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Vpreb3D3Z6J4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC17,89■□□□□ 0,45
Vpreb3D3Z6J4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Vpreb3D3Z6J4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC17,88■□□□□ 0,45
Vpreb3D3Z6J4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Vpreb3D3Z6J4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Vpreb3D3Z6J4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,74■□□□□ 0,43
Vpreb3D3Z6J4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17,73■□□□□ 0,43
Vpreb3D3Z6J4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
Vpreb3D3Z6J4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
Vpreb3D3Z6J4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Vpreb3D3Z6J4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Vpreb3D3Z6J4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC17,67■□□□□ 0,42
Vpreb3D3Z6J4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
Vpreb3D3Z6J4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
Vpreb3D3Z6J4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
Vpreb3D3Z6J4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
Vpreb3D3Z6J4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,63■□□□□ 0,41
Vpreb3D3Z6J4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,62■□□□□ 0,41
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,61■□□□□ 0,41
Vpreb3D3Z6J4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
Vpreb3D3Z6J4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC17,59■□□□□ 0,41
Vpreb3D3Z6J4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
Vpreb3D3Z6J4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Vpreb3D3Z6J4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,5■□□□□ 0,39
Vpreb3D3Z6J4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,5■□□□□ 0,39
Vpreb3D3Z6J4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,49■□□□□ 0,39
Vpreb3D3Z6J4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17,49■□□□□ 0,39
Vpreb3D3Z6J4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Vpreb3D3Z6J4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Vpreb3D3Z6J4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC17,46■□□□□ 0,39
Vpreb3D3Z6J4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Vpreb3D3Z6J4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Vpreb3D3Z6J4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17,4■□□□□ 0,38
Vpreb3D3Z6J4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Vpreb3D3Z6J4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Vpreb3D3Z6J4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Vpreb3D3Z6J4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
Vpreb3D3Z6J4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
Vpreb3D3Z6J4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17,29■□□□□ 0,36
Vpreb3D3Z6J4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Vpreb3D3Z6J4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,28■□□□□ 0,36
Vpreb3D3Z6J4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,27■□□□□ 0,35
Vpreb3D3Z6J4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
Vpreb3D3Z6J4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Vpreb3D3Z6J4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Vpreb3D3Z6J4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
Vpreb3D3Z6J4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,2■□□□□ 0,34
Vpreb3D3Z6J4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,18■□□□□ 0,34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms