Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SvipQ3UZP4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SvipQ3UZP4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SvipQ3UZP4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SvipQ3UZP4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SvipQ3UZP4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SvipQ3UZP4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SvipQ3UZP4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SvipQ3UZP4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SvipQ3UZP4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SvipQ3UZP4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SvipQ3UZP4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SvipQ3UZP4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SvipQ3UZP4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SvipQ3UZP4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SvipQ3UZP4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SvipQ3UZP4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SvipQ3UZP4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SvipQ3UZP4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SvipQ3UZP4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SvipQ3UZP4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SvipQ3UZP4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SvipQ3UZP4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SvipQ3UZP4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SvipQ3UZP4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SvipQ3UZP4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SvipQ3UZP4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SvipQ3UZP4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SvipQ3UZP4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SvipQ3UZP4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SvipQ3UZP4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SvipQ3UZP4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SvipQ3UZP4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SvipQ3UZP4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SvipQ3UZP4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SvipQ3UZP4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SvipQ3UZP4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SvipQ3UZP4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SvipQ3UZP4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SvipQ3UZP4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SvipQ3UZP4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SvipQ3UZP4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SvipQ3UZP4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SvipQ3UZP4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SvipQ3UZP4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SvipQ3UZP4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SvipQ3UZP4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SvipQ3UZP4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SvipQ3UZP4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SvipQ3UZP4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SvipQ3UZP4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SvipQ3UZP4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SvipQ3UZP4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SvipQ3UZP4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SvipQ3UZP4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SvipQ3UZP4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SvipQ3UZP4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SvipQ3UZP4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SvipQ3UZP4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SvipQ3UZP4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SvipQ3UZP4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SvipQ3UZP4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SvipQ3UZP4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SvipQ3UZP4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SvipQ3UZP4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SvipQ3UZP4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvipQ3UZP4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvipQ3UZP4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SvipQ3UZP4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SvipQ3UZP4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SvipQ3UZP4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SvipQ3UZP4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SvipQ3UZP4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SvipQ3UZP4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SvipQ3UZP4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SvipQ3UZP4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SvipQ3UZP4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SvipQ3UZP4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SvipQ3UZP4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SvipQ3UZP4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SvipQ3UZP4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SvipQ3UZP4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SvipQ3UZP4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SvipQ3UZP4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SvipQ3UZP4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SvipQ3UZP4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SvipQ3UZP4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SvipQ3UZP4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SvipQ3UZP4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SvipQ3UZP4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SvipQ3UZP4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SvipQ3UZP4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SvipQ3UZP4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SvipQ3UZP4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SvipQ3UZP4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SvipQ3UZP4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SvipQ3UZP4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SvipQ3UZP4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvipQ3UZP4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SvipQ3UZP4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms