Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
P06320 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,56■□□□□ 0,88
P06320 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
P06320 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC20,41■□□□□ 0,86
P06320 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
P06320 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20,02■□□□□ 0,8
P06320 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
P06320 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
P06320 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
P06320 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
P06320 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
P06320 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,09■□□□□ 0,65
P06320 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
P06320 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
P06320 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC18,95■□□□□ 0,62
P06320 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
P06320 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
P06320 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,79■□□□□ 0,6
P06320 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,79■□□□□ 0,6
P06320 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC18,74■□□□□ 0,59
P06320 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18,59■□□□□ 0,57
P06320 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC18,59■□□□□ 0,57
P06320 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,59■□□□□ 0,57
P06320 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC18,56■□□□□ 0,56
P06320 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC18,53■□□□□ 0,56
P06320 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,52■□□□□ 0,55
P06320 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,4■□□□□ 0,54
P06320 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,38■□□□□ 0,53
P06320 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
P06320 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
P06320 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,28■□□□□ 0,52
P06320 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC18,23■□□□□ 0,51
P06320 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC18,22■□□□□ 0,51
P06320 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
P06320 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
P06320 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18,11■□□□□ 0,49
P06320 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
P06320 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18,1■□□□□ 0,49
P06320 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
P06320 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
P06320 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
P06320 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
P06320 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,06■□□□□ 0,48
P06320 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18,04■□□□□ 0,48
P06320 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18,03■□□□□ 0,48
P06320 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,48
P06320 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
P06320 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC17,99■□□□□ 0,47
P06320 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
P06320 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
P06320 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
P06320 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
P06320 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC17,81■□□□□ 0,44
P06320 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
P06320 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,76■□□□□ 0,43
P06320 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
P06320 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
P06320 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
P06320 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
P06320 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
P06320 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17,61■□□□□ 0,41
P06320 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
P06320 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,39
P06320 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17,5■□□□□ 0,39
P06320 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,49■□□□□ 0,39
P06320 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,47■□□□□ 0,39
P06320 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
P06320 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
P06320 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC17,43■□□□□ 0,38
P06320 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
P06320 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
P06320 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
P06320 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17,36■□□□□ 0,37
P06320 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC17,35■□□□□ 0,37
P06320 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,34■□□□□ 0,37
P06320 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
P06320 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,32■□□□□ 0,36
P06320 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
P06320 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
P06320 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,36
P06320 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,26■□□□□ 0,35
P06320 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
P06320 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
P06320 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
P06320 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
P06320 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
P06320 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
P06320 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,18■□□□□ 0,34
P06320 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC17,17■□□□□ 0,34
P06320 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
P06320 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
P06320 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
P06320 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
P06320 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,14■□□□□ 0,33
P06320 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,13■□□□□ 0,33
P06320 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,13■□□□□ 0,33
P06320 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
P06320 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
P06320 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17,12■□□□□ 0,33
P06320 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,09■□□□□ 0,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms