Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
D130052B06RikQ3UW13 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
D130052B06RikQ3UW13 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
D130052B06RikQ3UW13 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
D130052B06RikQ3UW13 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
D130052B06RikQ3UW13 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
D130052B06RikQ3UW13 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
D130052B06RikQ3UW13 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
D130052B06RikQ3UW13 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
D130052B06RikQ3UW13 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
D130052B06RikQ3UW13 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
D130052B06RikQ3UW13 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D130052B06RikQ3UW13 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
D130052B06RikQ3UW13 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
D130052B06RikQ3UW13 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D130052B06RikQ3UW13 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
D130052B06RikQ3UW13 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
D130052B06RikQ3UW13 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
D130052B06RikQ3UW13 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
D130052B06RikQ3UW13 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
D130052B06RikQ3UW13 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
D130052B06RikQ3UW13 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
D130052B06RikQ3UW13 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
D130052B06RikQ3UW13 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
D130052B06RikQ3UW13 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D130052B06RikQ3UW13 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D130052B06RikQ3UW13 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
D130052B06RikQ3UW13 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
D130052B06RikQ3UW13 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
D130052B06RikQ3UW13 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
D130052B06RikQ3UW13 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
D130052B06RikQ3UW13 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
D130052B06RikQ3UW13 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
D130052B06RikQ3UW13 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
D130052B06RikQ3UW13 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
D130052B06RikQ3UW13 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
D130052B06RikQ3UW13 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
D130052B06RikQ3UW13 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
D130052B06RikQ3UW13 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
D130052B06RikQ3UW13 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
D130052B06RikQ3UW13 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
D130052B06RikQ3UW13 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
D130052B06RikQ3UW13 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
D130052B06RikQ3UW13 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
D130052B06RikQ3UW13 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
D130052B06RikQ3UW13 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
D130052B06RikQ3UW13 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
D130052B06RikQ3UW13 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
D130052B06RikQ3UW13 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
D130052B06RikQ3UW13 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
D130052B06RikQ3UW13 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
D130052B06RikQ3UW13 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
D130052B06RikQ3UW13 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
D130052B06RikQ3UW13 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
D130052B06RikQ3UW13 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
D130052B06RikQ3UW13 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
D130052B06RikQ3UW13 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
D130052B06RikQ3UW13 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
D130052B06RikQ3UW13 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
D130052B06RikQ3UW13 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
D130052B06RikQ3UW13 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
D130052B06RikQ3UW13 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
D130052B06RikQ3UW13 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
D130052B06RikQ3UW13 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
D130052B06RikQ3UW13 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
D130052B06RikQ3UW13 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D130052B06RikQ3UW13 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D130052B06RikQ3UW13 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
D130052B06RikQ3UW13 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130052B06RikQ3UW13 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130052B06RikQ3UW13 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130052B06RikQ3UW13 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130052B06RikQ3UW13 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
D130052B06RikQ3UW13 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
D130052B06RikQ3UW13 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
D130052B06RikQ3UW13 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
D130052B06RikQ3UW13 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
D130052B06RikQ3UW13 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
D130052B06RikQ3UW13 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
D130052B06RikQ3UW13 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
D130052B06RikQ3UW13 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
D130052B06RikQ3UW13 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130052B06RikQ3UW13 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
D130052B06RikQ3UW13 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
D130052B06RikQ3UW13 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
D130052B06RikQ3UW13 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D130052B06RikQ3UW13 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D130052B06RikQ3UW13 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
D130052B06RikQ3UW13 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
D130052B06RikQ3UW13 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D130052B06RikQ3UW13 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130052B06RikQ3UW13 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D130052B06RikQ3UW13 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D130052B06RikQ3UW13 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms