Protein–RNA interactions for Protein: Q61268

Apoc4, Apolipoprotein C-IV, mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc4Q61268 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Apoc4Q61268 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Apoc4Q61268 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Apoc4Q61268 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20,01■□□□□ 0,79
Apoc4Q61268 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Apoc4Q61268 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,81■□□□□ 0,76
Apoc4Q61268 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19,8■□□□□ 0,76
Apoc4Q61268 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Apoc4Q61268 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Apoc4Q61268 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
Apoc4Q61268 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Apoc4Q61268 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
Apoc4Q61268 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,42■□□□□ 0,7
Apoc4Q61268 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Apoc4Q61268 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
Apoc4Q61268 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Apoc4Q61268 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
Apoc4Q61268 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC19,09■□□□□ 0,65
Apoc4Q61268 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Apoc4Q61268 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18,99■□□□□ 0,63
Apoc4Q61268 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18,98■□□□□ 0,63
Apoc4Q61268 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,92■□□□□ 0,62
Apoc4Q61268 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,61
Apoc4Q61268 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC18,82■□□□□ 0,6
Apoc4Q61268 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Apoc4Q61268 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18,75■□□□□ 0,59
Apoc4Q61268 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,73■□□□□ 0,59
Apoc4Q61268 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Apoc4Q61268 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Apoc4Q61268 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,59■□□□□ 0,57
Apoc4Q61268 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,59■□□□□ 0,57
Apoc4Q61268 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,5■□□□□ 0,55
Apoc4Q61268 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,46■□□□□ 0,55
Apoc4Q61268 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,46■□□□□ 0,54
Apoc4Q61268 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,43■□□□□ 0,54
Apoc4Q61268 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,42■□□□□ 0,54
Apoc4Q61268 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18,41■□□□□ 0,54
Apoc4Q61268 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18,39■□□□□ 0,53
Apoc4Q61268 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,53
Apoc4Q61268 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18,31■□□□□ 0,52
Apoc4Q61268 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,25■□□□□ 0,51
Apoc4Q61268 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,24■□□□□ 0,51
Apoc4Q61268 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Apoc4Q61268 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Apoc4Q61268 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,08■□□□□ 0,48
Apoc4Q61268 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
Apoc4Q61268 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
Apoc4Q61268 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18,04■□□□□ 0,48
Apoc4Q61268 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Apoc4Q61268 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,93■□□□□ 0,46
Apoc4Q61268 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
Apoc4Q61268 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Apoc4Q61268 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Apoc4Q61268 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Apoc4Q61268 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Apoc4Q61268 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,85■□□□□ 0,45
Apoc4Q61268 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,45
Apoc4Q61268 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Apoc4Q61268 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Apoc4Q61268 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Apoc4Q61268 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Apoc4Q61268 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,75■□□□□ 0,43
Apoc4Q61268 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Apoc4Q61268 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Apoc4Q61268 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17,72■□□□□ 0,43
Apoc4Q61268 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
Apoc4Q61268 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC17,65■□□□□ 0,42
Apoc4Q61268 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,65■□□□□ 0,42
Apoc4Q61268 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
Apoc4Q61268 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
Apoc4Q61268 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
Apoc4Q61268 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Apoc4Q61268 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17,57■□□□□ 0,4
Apoc4Q61268 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
Apoc4Q61268 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,54■□□□□ 0,4
Apoc4Q61268 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,54■□□□□ 0,4
Apoc4Q61268 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
Apoc4Q61268 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
Apoc4Q61268 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
Apoc4Q61268 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Apoc4Q61268 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Apoc4Q61268 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Apoc4Q61268 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Apoc4Q61268 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Apoc4Q61268 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,39■□□□□ 0,37
Apoc4Q61268 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Apoc4Q61268 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,33■□□□□ 0,36
Apoc4Q61268 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Apoc4Q61268 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Apoc4Q61268 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17,3■□□□□ 0,36
Apoc4Q61268 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
Apoc4Q61268 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Apoc4Q61268 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Apoc4Q61268 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,25■□□□□ 0,35
Apoc4Q61268 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Apoc4Q61268 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17,21■□□□□ 0,35
Apoc4Q61268 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,2■□□□□ 0,34
Apoc4Q61268 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17,18■□□□□ 0,34
Apoc4Q61268 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
Apoc4Q61268 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
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