RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 NischQ80TM9 1593 aa47.74■■■■■ 5.23
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa47.29■■■■■ 5.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Abcc9P70170 1546 aa46.28■■■■■ 5
Suds3-201ENSMUST00000086471 Abcc8B2RUS7 1588 aa45.62■■■■■ 4.89
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rhox8Q6VSS7 320 aa43.38■■■■■ 4.53
Suds3-201ENSMUST00000086471 ScribQ80U72 1612 aa43.15■■■■■ 4.5
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dcaf1Q80TR8 1506 aa42.11■■■■■ 4.33
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kdm5dQ62240 1548 aa42.1■■■■■ 4.33
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa41.78■■■■■ 4.28
Suds3-201ENSMUST00000086471 NacadQ5SWP3 1504 aa41.76■■■■■ 4.28
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rtl1Q7M732 1744 aa41.3■■■■■ 4.2
Suds3-201ENSMUST00000086471 Baz1aO88379 1555 aa41.18■■■■■ 4.18
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sycp2Q9CUU3 1500 aa40.93■■■■■ 4.14
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc180J3QNE4 1664 aa40.91■■■■■ 4.14
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa40.42■■■■■ 4.06
Suds3-201ENSMUST00000086471 Crybg2B7ZCC2 1516 aa40.41■■■■■ 4.06
Suds3-201ENSMUST00000086471 BicraF8VPZ9 1578 aa40.25■■■■■ 4.03
Suds3-201ENSMUST00000086471 Smarca2Q6DIC0 1577 aa40.18■■■■■ 4.02
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa39.69■■■■□ 3.94
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trim41Q5NCC3 630 aa39.32■■■■□ 3.89
Suds3-201ENSMUST00000086471 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP39.09■■■■□ 3.85
Suds3-201ENSMUST00000086471 Synj1Q8CHC4 1574 aa39.07■■■■□ 3.85
Suds3-201ENSMUST00000086471 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
Suds3-201ENSMUST00000086471 CftrP26361 1476 aa38.86■■■■□ 3.81
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cngb1E1AZ71 1325 aa38.71■■■■□ 3.79
Suds3-201ENSMUST00000086471 HrcG5E8J6 738 aa38.7■■■■□ 3.79
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa38.64■■■■□ 3.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa38.58■■■■□ 3.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP38.51■■■■□ 3.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Golga3P55937 1487 aa38.43■■■■□ 3.74
Suds3-201ENSMUST00000086471 Chic1Q8CBW7 227 aa38.23■■■■□ 3.71
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP38.2■■■■□ 3.71
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa38.15■■■■□ 3.7
Suds3-201ENSMUST00000086471 Top2bQ64511 1612 aa38.12■■■■□ 3.69
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cep164Q5DU05 1446 aa38.04■■■■□ 3.68
Suds3-201ENSMUST00000086471 Frmpd1A2AKB4 1549 aa37.98■■■■□ 3.67
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa37.95■■■■□ 3.67
Suds3-201ENSMUST00000086471 Wdr62Q3U3T8 1523 aa37.93■■■■□ 3.66
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ercc6F8VPZ5 1481 aa37.85■■■■□ 3.65
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gab3Q8BSM5 595 aa37.78■■■■□ 3.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP37.65■■■■□ 3.62
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fmn1Q05860 1466 aa37.56■■■■□ 3.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Unc13aQ4KUS2 1712 aa37.55■■■■□ 3.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kif15Q6P9L6 1387 aa37.28■■■■□ 3.56
Suds3-201ENSMUST00000086471 TnnQ80Z71 1560 aa37.28■■■■□ 3.56
Suds3-201ENSMUST00000086471 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
Suds3-201ENSMUST00000086471 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lamc3Q9R0B6 1581 aa37.21■■■■□ 3.55
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa37.2■■■■□ 3.55
Suds3-201ENSMUST00000086471 Il27Q8K3I6 234 aa37.12■■■■□ 3.53
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ubl4bQ9CQ84 188 aa37.09■■■■□ 3.53
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fam135aQ6NS59 1506 aa37.07■■■■□ 3.52
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa36.88■■■■□ 3.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Camsap1A2AHC3 1581 aa36.85■■■■□ 3.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cux2P70298 1426 aa36.84■■■■□ 3.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Npm2Q80W85 207 aa36.75■■■■□ 3.47
Suds3-201ENSMUST00000086471 PtprkP35822 1457 aa36.71■■■■□ 3.47
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc18Q640L5 1455 aa36.68■■■■□ 3.46
Suds3-201ENSMUST00000086471 Myt1lP97500 1187 aa36.65■■■■□ 3.46
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cep162Q6ZQ06 1403 aa36.64■■■■□ 3.46
Suds3-201ENSMUST00000086471 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.45
Suds3-201ENSMUST00000086471 Grin2bQ01097 1482 aa36.52■■■■□ 3.44
Suds3-201ENSMUST00000086471 Shroom4Q1W617 1475 aa36.42■■■■□ 3.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 NrkQ9R0G8 1455 aa36.38■■■■□ 3.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Arhgap35Q91YM2 1499 aa36.34■■■■□ 3.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mrc2Q64449 1479 aa36.33■■■■□ 3.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zeb1Q64318 1117 aa36.24■■■■□ 3.39
Suds3-201ENSMUST00000086471 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
Suds3-201ENSMUST00000086471 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kif21aQ9QXL2 1672 aa36.19■■■■□ 3.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Duox2A2AQ99 1517 aa36.17■■■■□ 3.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Baz1bQ9Z277 1479 aa36.13■■■■□ 3.37
Suds3-201ENSMUST00000086471 Efcab5A0JP43 1406 aa36.03■■■■□ 3.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa36.02■■■■□ 3.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Samd9lQ69Z37 1561 aa36■■■■□ 3.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Map3k1P53349 1493 aa35.94■■■■□ 3.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Clip1Q922J3 1391 aa35.93■■■■□ 3.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Crocc2F6XLV1 1638 aa35.92■■■■□ 3.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rad54l2Q99NG0 1466 aa35.87■■■■□ 3.33
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa35.85■■■■□ 3.33
Suds3-201ENSMUST00000086471 Plb1Q3TTY0 1478 aa35.78■■■■□ 3.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa35.78■■■■□ 3.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 UbtfP25976 765 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa35.74■■■■□ 3.31
Suds3-201ENSMUST00000086471 Arap1Q4LDD4 1452 aa35.72■■■■□ 3.31
Suds3-201ENSMUST00000086471 SynmQ70IV5 1561 aa35.72■■■■□ 3.31
Suds3-201ENSMUST00000086471 Setd5Q5XJV7 1441 aa35.71■■■■□ 3.31
Suds3-201ENSMUST00000086471 Eea1Q8BL66 1411 aa35.7■■■■□ 3.3
Suds3-201ENSMUST00000086471 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
Suds3-201ENSMUST00000086471 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
Suds3-201ENSMUST00000086471 Carmil1Q6EDY6 1374 aa35.64■■■■□ 3.3
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ankrd26Q811D2 1581 aa35.62■■■■□ 3.29
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cux1P53564 1515 aa35.61■■■■□ 3.29
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