Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1P2

Defa21, Alpha-defensin 21, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa21Q8C1P2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Defa21Q8C1P2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Defa21Q8C1P2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Defa21Q8C1P2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Defa21Q8C1P2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19,9■□□□□ 0,78
Defa21Q8C1P2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC19,59■□□□□ 0,73
Defa21Q8C1P2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC19,54■□□□□ 0,72
Defa21Q8C1P2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Defa21Q8C1P2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,52■□□□□ 0,72
Defa21Q8C1P2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
Defa21Q8C1P2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Defa21Q8C1P2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,09■□□□□ 0,65
Defa21Q8C1P2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Defa21Q8C1P2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Defa21Q8C1P2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
Defa21Q8C1P2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Defa21Q8C1P2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
Defa21Q8C1P2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Defa21Q8C1P2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Defa21Q8C1P2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC18,9■□□□□ 0,62
Defa21Q8C1P2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18,86■□□□□ 0,61
Defa21Q8C1P2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Defa21Q8C1P2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Defa21Q8C1P2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,63■□□□□ 0,57
Defa21Q8C1P2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,62■□□□□ 0,57
Defa21Q8C1P2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,45■□□□□ 0,54
Defa21Q8C1P2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18,38■□□□□ 0,53
Defa21Q8C1P2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18,38■□□□□ 0,53
Defa21Q8C1P2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,37■□□□□ 0,53
Defa21Q8C1P2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,27■□□□□ 0,52
Defa21Q8C1P2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,26■□□□□ 0,51
Defa21Q8C1P2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18,25■□□□□ 0,51
Defa21Q8C1P2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,24■□□□□ 0,51
Defa21Q8C1P2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,23■□□□□ 0,51
Defa21Q8C1P2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Defa21Q8C1P2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Defa21Q8C1P2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Defa21Q8C1P2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Defa21Q8C1P2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Defa21Q8C1P2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Defa21Q8C1P2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Defa21Q8C1P2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Defa21Q8C1P2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Defa21Q8C1P2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Defa21Q8C1P2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18,07■□□□□ 0,48
Defa21Q8C1P2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Defa21Q8C1P2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Defa21Q8C1P2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Defa21Q8C1P2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Defa21Q8C1P2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,92■□□□□ 0,46
Defa21Q8C1P2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Defa21Q8C1P2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Defa21Q8C1P2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,9■□□□□ 0,46
Defa21Q8C1P2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Defa21Q8C1P2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Defa21Q8C1P2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Defa21Q8C1P2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Defa21Q8C1P2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Defa21Q8C1P2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17,8■□□□□ 0,44
Defa21Q8C1P2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17,79■□□□□ 0,44
Defa21Q8C1P2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17,79■□□□□ 0,44
Defa21Q8C1P2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Defa21Q8C1P2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC17,75■□□□□ 0,43
Defa21Q8C1P2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
Defa21Q8C1P2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
Defa21Q8C1P2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Defa21Q8C1P2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC17,68■□□□□ 0,42
Defa21Q8C1P2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
Defa21Q8C1P2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
Defa21Q8C1P2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
Defa21Q8C1P2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
Defa21Q8C1P2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
Defa21Q8C1P2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
Defa21Q8C1P2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,55■□□□□ 0,4
Defa21Q8C1P2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,55■□□□□ 0,4
Defa21Q8C1P2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,54■□□□□ 0,4
Defa21Q8C1P2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,4
Defa21Q8C1P2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
Defa21Q8C1P2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Defa21Q8C1P2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Defa21Q8C1P2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,49■□□□□ 0,39
Defa21Q8C1P2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,48■□□□□ 0,39
Defa21Q8C1P2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Defa21Q8C1P2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Defa21Q8C1P2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
Defa21Q8C1P2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17,45■□□□□ 0,38
Defa21Q8C1P2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,43■□□□□ 0,38
Defa21Q8C1P2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Defa21Q8C1P2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,37
Defa21Q8C1P2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,37
Defa21Q8C1P2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,37
Defa21Q8C1P2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,37
Defa21Q8C1P2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Defa21Q8C1P2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Defa21Q8C1P2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC17,37■□□□□ 0,37
Defa21Q8C1P2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Defa21Q8C1P2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,36■□□□□ 0,37
Defa21Q8C1P2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Defa21Q8C1P2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Defa21Q8C1P2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC17,35■□□□□ 0,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms