RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Xirp2Q4U4S6 3784 aa14,63□□□□□ -0,07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10542F6XDR3 90 aa14,63□□□□□ -0,07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SelenowP63300 88 aa14,63□□□□□ -0,07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Wfdc17Q5SSJ1 76 aa14,63□□□□□ -0,07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nbeal2Q6ZQA0 2742 aa14,62□□□□□ -0,07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rpl35aO55142 110 aa14,61□□□□□ -0,07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Xcl1P47993 114 aa14,61□□□□□ -0,07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1700011M02RikB1AX35 88 aa14,61□□□□□ -0,07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm11020F6ZGD5 61 aa14,61□□□□□ -0,07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav13n-1A0A0G2JEU8 110 aa14,59□□□□□ -0,07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv2-9-1A0A075B697 116 aa14,59□□□□□ -0,07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1810062G17RikG3X8Y2 129 aa14,59□□□□□ -0,07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tm2d2Q8R0I4 213 aa14,59□□□□□ -0,07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ndufa3Q9CQ91 84 aa14,58□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav11A0A0B4J1J9 114 aa14,57□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 5730596B20RikQ8BQ08 205 aa14,57□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm4861Q8C5A4 106 aa14,57□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav14d-3-dv8A0A075B619 120 aa14,56□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smim20D3Z7Q2 69 aa14,56□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 RetnQ99P87 114 aa14,56□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ss18l2Q9D174 77 aa14,56□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spata3Q9D9T6 193 aa14,56□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 A830031A19RikQ8BNT5 113 aa14,55□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav3-4A0A075B654 114 aa14,55□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 GfyJ3KML8 504 aa14,55□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01745 121 aa14,55□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmo1Q5SXG7 201 aa14,55□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PkigO70139 76 aa14,54□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01729 129 aa14,54□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm43218A0A0G2JGT0 114 aa14,53□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp1r32Q148A4 427 aa14,52□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfand2aQ9JII7 171 aa14,52□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Esm1Q9QYY7 184 aa14,52□□□□□ -0,08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf740Q6NZQ6 180 aa14,52□□□□□ -0,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4930524J08RikQ9CUJ5 163 aa14,52□□□□□ -0,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm16381A0A1Y7VKT9 73 aa14,51□□□□□ -0,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MobpQ9D2P8 170 aa14,51□□□□□ -0,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spry2Q9QXV8 315 aa14,51□□□□□ -0,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pglyrp4Q0VB07 374 aa14,5□□□□□ -0,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Apoc4Q61268 124 aa14,5□□□□□ -0,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP14,5□□□□□ -0,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv1-56A0A0A6YXG2 117 aa14,5□□□□□ -0,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Defb50Q6TU36 73 aa14,49□□□□□ -0,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krtap10-10A0A1W2P7T6 217 aa14,48□□□□□ -0,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Psors1c2Q80ZC9 134 aa14,48□□□□□ -0,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prss58Q8BW11 241 aa14,48□□□□□ -0,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10772F7AIG4 85 aa14,48□□□□□ -0,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nop10Q9CQS2 64 aa14,47□□□□□ -0,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tenm1Q9WTS4 2731 aa14,47□□□□□ -0,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tcl1b3P56842 122 aa14,46□□□□□ -0,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igkv4-72A0A0B4J1I4 117 aa14,46□□□□□ -0,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav9d-4A0A0G2JG37 103 aa14,46□□□□□ -0,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hist1h4aP62806 103 aaKnown RBP14,46□□□□□ -0,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ntn5Q3UQ22 452 aa14,45□□□□□ -0,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smim26Q3V460 107 aa14,45□□□□□ -0,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ndufa12Q7TMF3 145 aaKnown RBP14,45□□□□□ -0,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mzt1Q8BUR9 78 aa14,45□□□□□ -0,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpha2Q925Q5 128 aa14,45□□□□□ -0,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CrygfQ9CXV3 174 aa14,45□□□□□ -0,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igkv1-117A0A140T8M0 119 aa14,42□□□□□ -0,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krtap16-1A2A5X5 502 aa14,42□□□□□ -0,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spink1P09036 80 aa14,42□□□□□ -0,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm9513B3GLJ6 99 aa14,41□□□□□ -0,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sprr1bQ62267 153 aa14,4□□□□□ -0,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10647E9Q8X0 124 aa14,4□□□□□ -0,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CrygdP04342 174 aa14,39□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CrygeQ03740 174 aa14,39□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4930544G11RikQ9CR99 193 aa14,39□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4930519P11RikQ9CUJ8 166 aa14,39□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnal4Q9DCM4 105 aa14,39□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav13-4-dv7A0A075B6C2 110 aa14,38□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv1-49A0A0A6YWX2 117 aa14,38□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spink4O35679 86 aa14,38□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Defa1P11477 93 aa14,38□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem223Q9CQE2 199 aaKnown RBP14,38□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav9d-3A0A075B695 113 aa14,38□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp951A0A087WRH0 451 aa14,38□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm36176A0A1W2P8D5 158 aa14,37□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igf1P05017 153 aa14,35□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Defa25Q5G864 92 aa14,35□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cmc4Q61908 68 aa14,35□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q8R092 253 aa14,35□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hivep3A2A884 2348 aa14,35□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Srrm2Q8BTI8 2703 aaKnown RBP14,35□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv8-11A0A075B5X4 119 aa14,33□□□□□ -0,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01755 137 aa14,33□□□□□ -0,12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Defa16P50714 93 aa14,32□□□□□ -0,12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pfn2Q9JJV2 140 aa14,32□□□□□ -0,12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Klk11Q9QYN3 276 aa14,32□□□□□ -0,12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Notch3Q61982 2318 aa14,32□□□□□ -0,12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igkv1-99F6XWB2 120 aa14,31□□□□□ -0,12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Csdc2Q91YQ3 154 aa14,31□□□□□ -0,12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Brwd1Q921C3 2304 aa14,31□□□□□ -0,12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hbb-b2P02089 147 aa14,31□□□□□ -0,12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rpl18aP62717 176 aaKnown RBP14,31□□□□□ -0,12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Odf3l2Q3TZ65 277 aa14,31□□□□□ -0,12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TnxbO35452 4006 aa14,3□□□□□ -0,12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igkv1-35A0A0G2JDE5 120 aa14,29□□□□□ -0,12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ifitm6A0A1B0GS75 124 aa14,29□□□□□ -0,12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Inafm2A0A1L1STD6 152 aa14,29□□□□□ -0,12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,1 ms