Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXG2

Ighv1-56, Immunoglobulin heavy variable 1-56 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23,42■■□□□ 1,34
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21,44■■□□□ 1,02
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Ighv1-56A0A0A6YXG2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,02■□□□□ 0,96
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ighv1-56A0A0A6YXG2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20,64■□□□□ 0,89
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20,63■□□□□ 0,89
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,84
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,8
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,8
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20,05■□□□□ 0,8
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Ighv1-56A0A0A6YXG2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20,03■□□□□ 0,8
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19,91■□□□□ 0,78
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19,85■□□□□ 0,77
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19,65■□□□□ 0,74
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19,65■□□□□ 0,74
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19,58■□□□□ 0,73
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19,56■□□□□ 0,72
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,52■□□□□ 0,72
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,51■□□□□ 0,71
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19,41■□□□□ 0,7
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19,32■□□□□ 0,68
Ighv1-56A0A0A6YXG2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19,3■□□□□ 0,68
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19,29■□□□□ 0,68
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,27■□□□□ 0,67
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,25■□□□□ 0,67
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,16■□□□□ 0,66
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19,16■□□□□ 0,66
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Ighv1-56A0A0A6YXG2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19,04■□□□□ 0,64
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,95■□□□□ 0,62
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18,84■□□□□ 0,61
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,8■□□□□ 0,6
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,79■□□□□ 0,6
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18,62■□□□□ 0,57
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,6■□□□□ 0,57
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,6■□□□□ 0,57
Ighv1-56A0A0A6YXG2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,59■□□□□ 0,57
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,58■□□□□ 0,56
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,54■□□□□ 0,56
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18,54■□□□□ 0,56
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18,51■□□□□ 0,55
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,51■□□□□ 0,55
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,49■□□□□ 0,55
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,49■□□□□ 0,55
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18,48■□□□□ 0,55
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,48■□□□□ 0,55
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18,45■□□□□ 0,54
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18,44■□□□□ 0,54
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,44■□□□□ 0,54
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,43■□□□□ 0,54
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,41■□□□□ 0,54
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,4■□□□□ 0,54
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,4■□□□□ 0,54
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,36■□□□□ 0,53
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,53
Ighv1-56A0A0A6YXG2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms