Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZ65

Odf3l2, Outer dense fiber protein 3-like protein 2, mousemouse

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Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3l2Q3TZ65 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf3l2Q3TZ65 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odf3l2Q3TZ65 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Odf3l2Q3TZ65 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Odf3l2Q3TZ65 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odf3l2Q3TZ65 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf3l2Q3TZ65 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Odf3l2Q3TZ65 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Odf3l2Q3TZ65 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Odf3l2Q3TZ65 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf3l2Q3TZ65 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Odf3l2Q3TZ65 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odf3l2Q3TZ65 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Odf3l2Q3TZ65 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf3l2Q3TZ65 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf3l2Q3TZ65 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf3l2Q3TZ65 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf3l2Q3TZ65 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf3l2Q3TZ65 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Odf3l2Q3TZ65 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Odf3l2Q3TZ65 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odf3l2Q3TZ65 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odf3l2Q3TZ65 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Odf3l2Q3TZ65 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Odf3l2Q3TZ65 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odf3l2Q3TZ65 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Odf3l2Q3TZ65 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odf3l2Q3TZ65 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Odf3l2Q3TZ65 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Odf3l2Q3TZ65 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf3l2Q3TZ65 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf3l2Q3TZ65 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf3l2Q3TZ65 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf3l2Q3TZ65 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Odf3l2Q3TZ65 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Odf3l2Q3TZ65 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Odf3l2Q3TZ65 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Odf3l2Q3TZ65 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Odf3l2Q3TZ65 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Odf3l2Q3TZ65 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Odf3l2Q3TZ65 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Odf3l2Q3TZ65 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf3l2Q3TZ65 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Odf3l2Q3TZ65 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Odf3l2Q3TZ65 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Odf3l2Q3TZ65 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Odf3l2Q3TZ65 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Odf3l2Q3TZ65 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf3l2Q3TZ65 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf3l2Q3TZ65 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf3l2Q3TZ65 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Odf3l2Q3TZ65 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Odf3l2Q3TZ65 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Odf3l2Q3TZ65 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Odf3l2Q3TZ65 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Odf3l2Q3TZ65 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Odf3l2Q3TZ65 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Odf3l2Q3TZ65 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Odf3l2Q3TZ65 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Odf3l2Q3TZ65 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Odf3l2Q3TZ65 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Odf3l2Q3TZ65 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Odf3l2Q3TZ65 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Odf3l2Q3TZ65 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Odf3l2Q3TZ65 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Odf3l2Q3TZ65 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Odf3l2Q3TZ65 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Odf3l2Q3TZ65 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Odf3l2Q3TZ65 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Odf3l2Q3TZ65 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Odf3l2Q3TZ65 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Odf3l2Q3TZ65 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf3l2Q3TZ65 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf3l2Q3TZ65 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf3l2Q3TZ65 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf3l2Q3TZ65 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Odf3l2Q3TZ65 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Odf3l2Q3TZ65 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Odf3l2Q3TZ65 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Odf3l2Q3TZ65 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Odf3l2Q3TZ65 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Odf3l2Q3TZ65 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Odf3l2Q3TZ65 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Odf3l2Q3TZ65 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Odf3l2Q3TZ65 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf3l2Q3TZ65 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf3l2Q3TZ65 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf3l2Q3TZ65 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf3l2Q3TZ65 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf3l2Q3TZ65 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf3l2Q3TZ65 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf3l2Q3TZ65 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf3l2Q3TZ65 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf3l2Q3TZ65 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf3l2Q3TZ65 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Odf3l2Q3TZ65 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Odf3l2Q3TZ65 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Odf3l2Q3TZ65 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf3l2Q3TZ65 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf3l2Q3TZ65 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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