RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NischQ80TM9 1593 aa41,26■■■■■ 4,2
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa41,14■■■■■ 4,18
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ScribQ80U72 1612 aa37,72■■■■□ 3,63
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rhox8Q6VSS7 320 aa37,24■■■■□ 3,55
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dcaf1Q80TR8 1506 aa36,71■■■■□ 3,47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rtl1Q7M732 1744 aa36,58■■■■□ 3,45
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NacadQ5SWP3 1504 aa36,38■■■■□ 3,41
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kdm5dQ62240 1548 aa36,37■■■■□ 3,41
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa36,14■■■■□ 3,38
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc180J3QNE4 1664 aa35,93■■■■□ 3,34
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Baz1aO88379 1555 aa35,7■■■■□ 3,31
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sycp2Q9CUU3 1500 aa35,7■■■■□ 3,31
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 BicraF8VPZ9 1578 aa35,32■■■■□ 3,24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Crybg2B7ZCC2 1516 aa35,22■■■■□ 3,23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP35,1■■■■□ 3,21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa35■■■■□ 3,19
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smarca2Q6DIC0 1577 aa34,82■■■■□ 3,16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa34,77■■■■□ 3,16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa34,56■■■■□ 3,12
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trim41Q5NCC3 630 aa34,07■■■■□ 3,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HrcG5E8J6 738 aa34,05■■■■□ 3,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa34,03■■■■□ 3,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP33,91■■■■□ 3,02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP33,91■■■■□ 3,02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP33,88■■■■□ 3,01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Synj1Q8CHC4 1574 aa33,71■■■□□ 2,99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP33,7■■■□□ 2,99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa33,65■■■□□ 2,98
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ercc6F8VPZ5 1481 aa33,6■■■□□ 2,97
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa33,56■■■□□ 2,96
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CftrP26361 1476 aa33,53■■■□□ 2,96
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa33,46■■■□□ 2,95
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam135aQ6NS59 1506 aa33,32■■■□□ 2,92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Golga3P55937 1487 aa33,29■■■□□ 2,92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cngb1E1AZ71 1325 aa33,22■■■□□ 2,91
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Wdr62Q3U3T8 1523 aa33,2■■■□□ 2,91
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Frmpd1A2AKB4 1549 aa33,16■■■□□ 2,9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP33,14■■■□□ 2,9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Top2bQ64511 1612 aa33,1■■■□□ 2,89
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cep164Q5DU05 1446 aa33,07■■■□□ 2,88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP32,97■■■□□ 2,87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP32,89■■■□□ 2,85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Unc13aQ4KUS2 1712 aa32,83■■■□□ 2,85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa32,79■■■□□ 2,84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Baz1bQ9Z277 1479 aa32,77■■■□□ 2,84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Chic1Q8CBW7 227 aa32,74■■■□□ 2,83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ubl4bQ9CQ84 188 aa32,71■■■□□ 2,83
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fmn1Q05860 1466 aa32,6■■■□□ 2,81
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP32,31■■■□□ 2,76
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lamc3Q9R0B6 1581 aa32,24■■■□□ 2,75
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kif15Q6P9L6 1387 aa32,05■■■□□ 2,72
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa31,97■■■□□ 2,71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa31,94■■■□□ 2,7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cux2P70298 1426 aa31,91■■■□□ 2,7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Camsap1A2AHC3 1581 aa31,87■■■□□ 2,69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kif21aQ9QXL2 1672 aa31,82■■■□□ 2,68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NefmP08553 848 aa31,78■■■□□ 2,68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc18Q640L5 1455 aa31,76■■■□□ 2,68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP31,75■■■□□ 2,67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cep162Q6ZQ06 1403 aa31,69■■■□□ 2,66
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Npm2Q80W85 207 aa31,64■■■□□ 2,66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnajc5P60904 198 aa31,63■■■□□ 2,65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP31,61■■■□□ 2,65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NrkQ9R0G8 1455 aa31,57■■■□□ 2,64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Grin2bQ01097 1482 aa31,54■■■□□ 2,64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Shroom4Q1W617 1475 aa31,54■■■□□ 2,64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP31,52■■■□□ 2,64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PtprkP35822 1457 aa31,49■■■□□ 2,63
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP31,43■■■□□ 2,62
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Myt1lP97500 1187 aa31,41■■■□□ 2,62
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arhgap35Q91YM2 1499 aa31,38■■■□□ 2,61
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mier1Q5UAK0 511 aa31,3■■■□□ 2,6
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP31,3■■■□□ 2,6
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Map3k1P53349 1493 aa31,28■■■□□ 2,6
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP31,22■■■□□ 2,59
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Efcab5A0JP43 1406 aa31,2■■■□□ 2,59
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Neurod1Q60867 357 aa31,18■■■□□ 2,58
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Duox2A2AQ99 1517 aa31,17■■■□□ 2,58
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa31,16■■■□□ 2,58
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Shroom2A2ALU4 1481 aa31,13■■■□□ 2,57
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Crocc2F6XLV1 1638 aa31,11■■■□□ 2,57
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zeb1Q64318 1117 aa31,11■■■□□ 2,57
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP31,08■■■□□ 2,57
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP31,06■■■□□ 2,56
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Clip1Q922J3 1391 aa31,05■■■□□ 2,56
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Samd9lQ69Z37 1561 aa31■■■□□ 2,55
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Eea1Q8BL66 1411 aa30,94■■■□□ 2,54
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