Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23,6■■□□□ 1,37
Sprr1bQ62267 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Sprr1bQ62267 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Sprr1bQ62267 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,62■■□□□ 1,21
Sprr1bQ62267 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21,87■■□□□ 1,09
Sprr1bQ62267 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Sprr1bQ62267 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Sprr1bQ62267 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Sprr1bQ62267 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Sprr1bQ62267 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,24■□□□□ 0,99
Sprr1bQ62267 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Sprr1bQ62267 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Sprr1bQ62267 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Sprr1bQ62267 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20,98■□□□□ 0,95
Sprr1bQ62267 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Sprr1bQ62267 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Sprr1bQ62267 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Sprr1bQ62267 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20,87■□□□□ 0,93
Sprr1bQ62267 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Sprr1bQ62267 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Sprr1bQ62267 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Sprr1bQ62267 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20,4■□□□□ 0,86
Sprr1bQ62267 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Sprr1bQ62267 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Sprr1bQ62267 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Sprr1bQ62267 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Sprr1bQ62267 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Sprr1bQ62267 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Sprr1bQ62267 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Sprr1bQ62267 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20,26■□□□□ 0,83
Sprr1bQ62267 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Sprr1bQ62267 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20,19■□□□□ 0,82
Sprr1bQ62267 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Sprr1bQ62267 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Sprr1bQ62267 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Sprr1bQ62267 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20,04■□□□□ 0,8
Sprr1bQ62267 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Sprr1bQ62267 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20,02■□□□□ 0,8
Sprr1bQ62267 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19,95■□□□□ 0,78
Sprr1bQ62267 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19,93■□□□□ 0,78
Sprr1bQ62267 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Sprr1bQ62267 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Sprr1bQ62267 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
Sprr1bQ62267 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19,82■□□□□ 0,76
Sprr1bQ62267 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Sprr1bQ62267 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Sprr1bQ62267 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
Sprr1bQ62267 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Sprr1bQ62267 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Sprr1bQ62267 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Sprr1bQ62267 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19,51■□□□□ 0,71
Sprr1bQ62267 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19,47■□□□□ 0,71
Sprr1bQ62267 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19,46■□□□□ 0,71
Sprr1bQ62267 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,42■□□□□ 0,7
Sprr1bQ62267 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19,41■□□□□ 0,7
Sprr1bQ62267 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
Sprr1bQ62267 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
Sprr1bQ62267 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19,36■□□□□ 0,69
Sprr1bQ62267 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,35■□□□□ 0,69
Sprr1bQ62267 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19,29■□□□□ 0,68
Sprr1bQ62267 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
Sprr1bQ62267 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
Sprr1bQ62267 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Sprr1bQ62267 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
Sprr1bQ62267 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
Sprr1bQ62267 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
Sprr1bQ62267 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
Sprr1bQ62267 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
Sprr1bQ62267 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19,14■□□□□ 0,66
Sprr1bQ62267 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Sprr1bQ62267 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Sprr1bQ62267 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Sprr1bQ62267 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,1■□□□□ 0,65
Sprr1bQ62267 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,08■□□□□ 0,65
Sprr1bQ62267 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
Sprr1bQ62267 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Sprr1bQ62267 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Sprr1bQ62267 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Sprr1bQ62267 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18,86■□□□□ 0,61
Sprr1bQ62267 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Sprr1bQ62267 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Sprr1bQ62267 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Sprr1bQ62267 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Sprr1bQ62267 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,78■□□□□ 0,6
Sprr1bQ62267 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,6
Sprr1bQ62267 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,6
Sprr1bQ62267 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18,74■□□□□ 0,59
Sprr1bQ62267 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Sprr1bQ62267 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,73■□□□□ 0,59
Sprr1bQ62267 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,73■□□□□ 0,59
Sprr1bQ62267 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Sprr1bQ62267 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Sprr1bQ62267 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Sprr1bQ62267 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,69■□□□□ 0,58
Sprr1bQ62267 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,57
Sprr1bQ62267 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18,62■□□□□ 0,57
Sprr1bQ62267 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,6■□□□□ 0,57
Sprr1bQ62267 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,6■□□□□ 0,57
Sprr1bQ62267 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18,58■□□□□ 0,56
Sprr1bQ62267 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18,56■□□□□ 0,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms