Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sprr1bQ62267 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sprr1bQ62267 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sprr1bQ62267 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sprr1bQ62267 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sprr1bQ62267 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sprr1bQ62267 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sprr1bQ62267 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sprr1bQ62267 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sprr1bQ62267 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sprr1bQ62267 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sprr1bQ62267 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sprr1bQ62267 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sprr1bQ62267 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sprr1bQ62267 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sprr1bQ62267 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sprr1bQ62267 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sprr1bQ62267 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sprr1bQ62267 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sprr1bQ62267 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sprr1bQ62267 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sprr1bQ62267 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sprr1bQ62267 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sprr1bQ62267 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sprr1bQ62267 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sprr1bQ62267 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sprr1bQ62267 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sprr1bQ62267 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sprr1bQ62267 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sprr1bQ62267 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sprr1bQ62267 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sprr1bQ62267 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sprr1bQ62267 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sprr1bQ62267 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sprr1bQ62267 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sprr1bQ62267 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sprr1bQ62267 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sprr1bQ62267 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sprr1bQ62267 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sprr1bQ62267 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sprr1bQ62267 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sprr1bQ62267 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sprr1bQ62267 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sprr1bQ62267 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Sprr1bQ62267 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sprr1bQ62267 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sprr1bQ62267 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sprr1bQ62267 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sprr1bQ62267 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sprr1bQ62267 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sprr1bQ62267 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sprr1bQ62267 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sprr1bQ62267 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sprr1bQ62267 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sprr1bQ62267 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Sprr1bQ62267 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sprr1bQ62267 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sprr1bQ62267 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sprr1bQ62267 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sprr1bQ62267 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sprr1bQ62267 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sprr1bQ62267 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sprr1bQ62267 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sprr1bQ62267 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sprr1bQ62267 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sprr1bQ62267 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sprr1bQ62267 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sprr1bQ62267 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sprr1bQ62267 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sprr1bQ62267 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sprr1bQ62267 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sprr1bQ62267 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sprr1bQ62267 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sprr1bQ62267 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sprr1bQ62267 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sprr1bQ62267 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sprr1bQ62267 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sprr1bQ62267 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sprr1bQ62267 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sprr1bQ62267 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sprr1bQ62267 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sprr1bQ62267 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sprr1bQ62267 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sprr1bQ62267 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sprr1bQ62267 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sprr1bQ62267 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sprr1bQ62267 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sprr1bQ62267 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sprr1bQ62267 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sprr1bQ62267 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sprr1bQ62267 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sprr1bQ62267 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sprr1bQ62267 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sprr1bQ62267 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sprr1bQ62267 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sprr1bQ62267 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sprr1bQ62267 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sprr1bQ62267 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sprr1bQ62267 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sprr1bQ62267 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms