Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X5

Krtap16-1, Keratin-associated protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap16-1A2A5X5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
Krtap16-1A2A5X5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Krtap16-1A2A5X5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Krtap16-1A2A5X5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Krtap16-1A2A5X5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,18■■□□□ 1,46
Krtap16-1A2A5X5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,98■■□□□ 1,43
Krtap16-1A2A5X5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Krtap16-1A2A5X5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,79■■□□□ 1,4
Krtap16-1A2A5X5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Krtap16-1A2A5X5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Krtap16-1A2A5X5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Krtap16-1A2A5X5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22,98■■□□□ 1,27
Krtap16-1A2A5X5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Krtap16-1A2A5X5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Krtap16-1A2A5X5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Krtap16-1A2A5X5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22,74■■□□□ 1,23
Krtap16-1A2A5X5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22,64■■□□□ 1,22
Krtap16-1A2A5X5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Krtap16-1A2A5X5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Krtap16-1A2A5X5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Krtap16-1A2A5X5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Krtap16-1A2A5X5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Krtap16-1A2A5X5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Krtap16-1A2A5X5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Krtap16-1A2A5X5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,28■■□□□ 1,16
Krtap16-1A2A5X5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Krtap16-1A2A5X5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,24■■□□□ 1,15
Krtap16-1A2A5X5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,24■■□□□ 1,15
Krtap16-1A2A5X5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,17■■□□□ 1,14
Krtap16-1A2A5X5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Krtap16-1A2A5X5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,88■■□□□ 1,09
Krtap16-1A2A5X5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Krtap16-1A2A5X5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Krtap16-1A2A5X5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
Krtap16-1A2A5X5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,82■■□□□ 1,08
Krtap16-1A2A5X5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Krtap16-1A2A5X5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Krtap16-1A2A5X5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Krtap16-1A2A5X5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Krtap16-1A2A5X5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Krtap16-1A2A5X5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Krtap16-1A2A5X5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Krtap16-1A2A5X5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Krtap16-1A2A5X5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Krtap16-1A2A5X5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Krtap16-1A2A5X5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,36■■□□□ 1,01
Krtap16-1A2A5X5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Krtap16-1A2A5X5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21,35■■□□□ 1,01
Krtap16-1A2A5X5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Krtap16-1A2A5X5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Krtap16-1A2A5X5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,26■□□□□ 0,99
Krtap16-1A2A5X5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21,25■□□□□ 0,99
Krtap16-1A2A5X5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21,25■□□□□ 0,99
Krtap16-1A2A5X5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Krtap16-1A2A5X5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Krtap16-1A2A5X5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Krtap16-1A2A5X5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Krtap16-1A2A5X5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Krtap16-1A2A5X5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,02■□□□□ 0,96
Krtap16-1A2A5X5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Krtap16-1A2A5X5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Krtap16-1A2A5X5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Krtap16-1A2A5X5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Krtap16-1A2A5X5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Krtap16-1A2A5X5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20,9■□□□□ 0,94
Krtap16-1A2A5X5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Krtap16-1A2A5X5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Krtap16-1A2A5X5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Krtap16-1A2A5X5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Krtap16-1A2A5X5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Krtap16-1A2A5X5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Krtap16-1A2A5X5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Krtap16-1A2A5X5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Krtap16-1A2A5X5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Krtap16-1A2A5X5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20,74■□□□□ 0,91
Krtap16-1A2A5X5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20,74■□□□□ 0,91
Krtap16-1A2A5X5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Krtap16-1A2A5X5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Krtap16-1A2A5X5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20,67■□□□□ 0,9
Krtap16-1A2A5X5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,66■□□□□ 0,9
Krtap16-1A2A5X5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Krtap16-1A2A5X5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Krtap16-1A2A5X5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Krtap16-1A2A5X5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Krtap16-1A2A5X5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Krtap16-1A2A5X5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Krtap16-1A2A5X5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Krtap16-1A2A5X5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20,51■□□□□ 0,87
Krtap16-1A2A5X5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Krtap16-1A2A5X5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Krtap16-1A2A5X5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Krtap16-1A2A5X5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Krtap16-1A2A5X5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Krtap16-1A2A5X5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Krtap16-1A2A5X5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Krtap16-1A2A5X5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Krtap16-1A2A5X5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Krtap16-1A2A5X5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20,33■□□□□ 0,85
Krtap16-1A2A5X5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20,27■□□□□ 0,84
Krtap16-1A2A5X5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms