Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
Defa1P11477 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Defa1P11477 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Defa1P11477 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Defa1P11477 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,87■■□□□ 1,09
Defa1P11477 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Defa1P11477 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Defa1P11477 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Defa1P11477 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21,53■■□□□ 1,04
Defa1P11477 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21,39■■□□□ 1,01
Defa1P11477 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Defa1P11477 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Defa1P11477 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Defa1P11477 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Defa1P11477 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Defa1P11477 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Defa1P11477 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20,82■□□□□ 0,92
Defa1P11477 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Defa1P11477 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Defa1P11477 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Defa1P11477 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Defa1P11477 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20,55■□□□□ 0,88
Defa1P11477 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20,43■□□□□ 0,86
Defa1P11477 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Defa1P11477 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Defa1P11477 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Defa1P11477 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Defa1P11477 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Defa1P11477 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Defa1P11477 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,21■□□□□ 0,83
Defa1P11477 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Defa1P11477 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20,19■□□□□ 0,82
Defa1P11477 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20,16■□□□□ 0,82
Defa1P11477 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Defa1P11477 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Defa1P11477 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Defa1P11477 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20,02■□□□□ 0,8
Defa1P11477 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19,99■□□□□ 0,79
Defa1P11477 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19,94■□□□□ 0,78
Defa1P11477 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,83■□□□□ 0,77
Defa1P11477 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Defa1P11477 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Defa1P11477 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19,74■□□□□ 0,75
Defa1P11477 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Defa1P11477 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Defa1P11477 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Defa1P11477 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Defa1P11477 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
Defa1P11477 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Defa1P11477 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Defa1P11477 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19,66■□□□□ 0,74
Defa1P11477 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Defa1P11477 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Defa1P11477 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,61■□□□□ 0,73
Defa1P11477 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19,61■□□□□ 0,73
Defa1P11477 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19,6■□□□□ 0,73
Defa1P11477 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,58■□□□□ 0,72
Defa1P11477 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19,54■□□□□ 0,72
Defa1P11477 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,47■□□□□ 0,71
Defa1P11477 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19,45■□□□□ 0,7
Defa1P11477 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Defa1P11477 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,39■□□□□ 0,69
Defa1P11477 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19,38■□□□□ 0,69
Defa1P11477 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
Defa1P11477 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
Defa1P11477 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19,34■□□□□ 0,69
Defa1P11477 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,31■□□□□ 0,68
Defa1P11477 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,29■□□□□ 0,68
Defa1P11477 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19,28■□□□□ 0,68
Defa1P11477 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
Defa1P11477 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Defa1P11477 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
Defa1P11477 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
Defa1P11477 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19,22■□□□□ 0,67
Defa1P11477 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
Defa1P11477 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19,19■□□□□ 0,66
Defa1P11477 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19,18■□□□□ 0,66
Defa1P11477 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Defa1P11477 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
Defa1P11477 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,64
Defa1P11477 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Defa1P11477 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19,03■□□□□ 0,64
Defa1P11477 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0,63
Defa1P11477 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Defa1P11477 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18,99■□□□□ 0,63
Defa1P11477 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,98■□□□□ 0,63
Defa1P11477 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18,98■□□□□ 0,63
Defa1P11477 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18,97■□□□□ 0,63
Defa1P11477 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Defa1P11477 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Defa1P11477 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Defa1P11477 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Defa1P11477 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,93■□□□□ 0,62
Defa1P11477 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Defa1P11477 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Defa1P11477 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Defa1P11477 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Defa1P11477 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,9■□□□□ 0,62
Defa1P11477 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,89■□□□□ 0,61
Defa1P11477 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18,88■□□□□ 0,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms