RNA–Protein interactions for RNA: YML078W

CPR3, Transcript of Mitochondrial peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR3, Length 549 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR3	YML078W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	ALG7	P07286	448 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	AAC3	P18238	307 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	APL3	P38065	1025 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	VPS4	P52917	437 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	COG1	P53079	417 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	ATG4	P53867	494 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	ATG23	Q06671	453 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	MLH3	Q12083	715 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	NTO1	Q12311	748 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	PDE1	P22434	369 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	PRE8	P23639	250 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	LNP1	P38878	278 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	YJR061W	P40355	935 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	ARG2	P40360	574 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	AIM21	P40563	679 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	YGR151C	P53287	111 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	SSL2	Q00578	843 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	MFM1	Q02783	413 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	YKU80	Q04437	629 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	GTB1	Q04924	702 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	TGS1	Q12052	315 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	NUS1	Q12063	375 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	USV1	Q12132	391 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	RKI1	Q12189	258 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	TRM13	Q12383	476 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	CTS1	P29029	562 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	ELF1	P36053	145 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	CCL1	P37366	393 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	TDP1	P38319	544 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	SIP4	P46954	829 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	SGM1	P47166	707 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	FCP1	Q03254	732 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	CRF1	Q04930	467 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	SCM3	Q12334	223 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR3	YML078W	FOB1	O13329	566 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	MRP20	P32387	263 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	UBP7	P40453	1071 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	IRC6	P43615	237 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	SPC98	P53540	846 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	SNF12	P53628	566 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	CRT10	Q08226	957 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	ERP4	Q12450	207 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	PCD1	Q12524	340 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	SGF29	P25554	259 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	URK1	P27515	501 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	CDC5	P32562	705 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	TFC3	P34111	1160 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	SUL1	P38359	859 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	YHL017W	P38745	532 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	AAD10	P47182	288 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	PHO23	P50947	330 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	TAM41	P53230	385 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	DIP5	P53388	608 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	BUD17	P53727	317 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	REG1	Q00816	1014 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	SWT1	Q12104	458 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	HUA2	Q12134	243 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	TAH18	Q12181	623 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	VCX1	Q99385	411 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	MET8	P15807	274 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	RNQ1	P25367	405 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	PGS1	P25578	521 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	CNE1	P27825	502 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	NFU1	P32860	256 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	PIH1	P38768	344 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	MAM1	P40065	302 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	NDC80	P40460	691 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	LYS14	P40971	790 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	VTC2	P43585	828 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	YIP4	P53093	235 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR3	YML078W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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