RNA–Protein interactions for RNA: YHR119W

SET1, Transcript of Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex, yeast

Gene SET1, Length 3,243 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET1	YHR119W	FLC2	P39719	783 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	NTA1	P40354	457 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	VNX1	P42839	908 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	RPA14	P50106	137 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	HDA1	P53973	706 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	SEG1	Q04279	960 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	CSI1	Q04368	295 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	MED4	Q12343	284 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	CTF3	Q12748	733 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	STE12	P13574	688 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	NFS1	P25374	497 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	MDL2	P33311	773 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	HEL1	P36113	551 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	UGA2	P38067	497 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	OPY1	P38271	328 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	LRO1	P40345	661 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	MMR1	Q06324	491 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	GRS2	Q06817	618 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	NSI1	Q12457	570 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	LAG2	Q92325	660 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	RAD61	Q99359	647 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	VMA3	P25515	160 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	ATP11	P32453	318 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	MAC1	P35192	417 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	OCT1	P35999	772 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	RFC3	P38629	340 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	PSD1	P39006	500 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	PRM2	P40534	656 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	MUB1	Q03162	620 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	NHX1	Q04121	633 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	FUS2	Q05670	677 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	YLR297W	Q05899	129 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	ERF2	Q06551	359 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	CTI6	Q08923	506 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	RCN2	Q12044	265 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SET1	YHR119W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YCR051W	P25631	222 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PRM9	P39551	298 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ALG5	P40350	334 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YFR018C	P43599	363 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MRX6	P48564	524 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	KAP114	P53067	1004 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YGR117C	P53270	476 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YNL146W	P53906	100 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	KTR6	P54070	446 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	TFC6	Q06339	672 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YOL107W	Q12239	342 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	BET2	P20133	325 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	GID7	P25569	745 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YKR015C	P36111	568 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	LYS9	P38999	446 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MSS2	P40990	351 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ALT2	P52892	507 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	NMA111	P53920	997 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MEC3	Q02574	474 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	JIP4	Q03361	876 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	IVY1	Q04934	453 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RTT103	Q05543	409 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YLR173W	Q06247	608 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SNA4	Q07549	140 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RIM20	Q12033	661 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	NBP2	Q12163	236 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	AFI1	Q99222	893 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ECM5	Q03214	1411 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	TRK1	P12685	1235 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MRPL8	P22353	238 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	CPR2	P23285	205 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	TRK2	P28584	889 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	AFG2	P32794	780 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YBL029W	P38201	376 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87

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