RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp5iQ06185 71 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tex26Q0VB26 296 aa8.73□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q24JP4 165 aa8.73□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dmbt1Q60997 2085 aa8.73□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igsf10Q3V1M1 2594 aa8.73□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv1-23A0A0A6YVW3 117 aa8.73□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 MycbQ6P8Z1 170 aa8.73□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tppp3Q9CRB6 176 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mien1Q9CQ86 115 aa8.72□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 H2al2bA9Z055 111 aa8.72□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdx4Q07424 282 aa8.72□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cotl1Q9CQI6 142 aa8.72□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm5157A0A087WRH8 301 aa8.72□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 LalbaP29752 143 aa8.72□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 H2-DMb1P35737 261 aa8.72□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gkn1Q9CR36 201 aa8.72□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr322Q5NCC8 327 aa8.71□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm10300Q8C8P7 189 aa8.71□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defb10Q8R2I8 73 aa8.71□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 Chchd1Q9CQA6 118 aa8.71□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gtsf1lQ9CWD0 151 aa8.71□□□□□ -1.01
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trav12d-3A0A075B6A4 115 aa8.71□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm42420A0A0J9YUQ2 99 aa8.71□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01747 120 aa8.71□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vamp3P63024 103 aa8.71□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spag11Q8K4N2 71 aa8.71□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tctex1d2Q9CQ66 144 aa8.71□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrpl53Q9D1H8 118 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mapk1ip1Q9D7G9 263 aa8.71□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1191-ps1A0A1L1STD5 311 aa8.71□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lyrm9Q3UN90 78 aa8.7□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ndufa4l2Q4FZG9 87 aa8.7□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr984Q8VFN1 314 aa8.7□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 PtprqP0C5E4 2300 aa8.7□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 PrlhG3UWC3 86 aa8.7□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Acrv1P50289 261 aa8.7□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm7489Q3UT34 171 aa8.7□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Megf9Q8BH27 600 aa8.7□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 EpcamQ99JW5 315 aa8.7□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ormdl3Q9CPZ6 153 aa8.7□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nbeal2Q6ZQA0 2742 aa8.7□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm765B2RVL9 189 aa8.69□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defa34D3Z0J0 93 aa8.69□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 1810011H11RikE9PVZ2 95 aa8.69□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defa37K9J724 93 aa8.69□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defa5P28312 93 aa8.69□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem241Q3UME2 297 aa8.69□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 RnasekQ8K3C0 98 aa8.69□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zmat5Q9CQR5 170 aa8.69□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 4930564D02RikQ9D4S4 103 aa8.69□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv8-6A0A0A6YXA3 118 aa8.69□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trbv14A0A140T8L9 115 aa8.69□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm45623A0A1B0GSF6 103 aa8.69□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm11733Q8BQP1 125 aa8.69□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ly6g5bQ8K1T4 194 aa8.69□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 PpbpQ9EQI5 113 aa8.69□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Xirp2Q4U4S6 3784 aa8.69□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sertad4A7DTG3 377 aa8.69□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 GalmQ8K157 342 aa8.69□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fmc1Q9CR13 113 aa8.69□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd24P24807 76 aa8.68□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mbd3l2Q3UXB0 228 aa8.68□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Khdc1cQ4KL78 166 aa8.68□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm6040Q4QY32 63 aa8.68□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd164l2Q9D6W7 172 aa8.68□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wfdc2Q9DAU7 174 aa8.68□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hoxa5P09021 270 aa8.68□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam19a2Q7TPG7 131 aa8.68□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm5426J3QNM7 103 aa8.68□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01753 117 aa8.68□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdx1P18111 268 aa8.68□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Emp2O88662 172 aa8.67□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm10271F6WY25 52 aa8.67□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 P06328 117 aa8.67□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cacng7P62956 275 aa8.67□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 7420426K07RikQ3UX66 186 aa8.67□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Foxi1Q922I5 372 aa8.67□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trav14-3A0A075B607 120 aa8.67□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 MdfiP70331 251 aa8.67□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ifi27l2aQ8R412 90 aa8.67□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igkv4-62A0A0G2JDW9 117 aa8.66□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r149E9PWL6 307 aa8.66□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r101E9Q365 307 aa8.66□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01791 123 aa8.66□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm26938S4R185 226 aa8.66□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv1-75A0A075B5Y2 117 aa8.66□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm28038F7BCN9 126 aa8.66□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 CrygfQ9CXV3 174 aa8.66□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Omt2bD3YX29 119 aa8.66□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rs1Q9Z1L4 224 aa8.66□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv3-3A0A0A6YWL2 116 aa8.65□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 1520401A03RikA0A0J9YVH6 598 aa8.65□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Crip3Q6Q6R3 243 aa8.65□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Psmb11Q8BG41 302 aa8.65□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1367Q8VFG2 316 aa8.65□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm9944Q8C559 102 aa8.65□□□□□ -1.02
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm20379A0A087WR34 119 aa8.65□□□□□ -1.03
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm815Q3UWS2 115 aa8.65□□□□□ -1.03
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tnfsf18Q7TS55 173 aa8.65□□□□□ -1.03
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hist3h2bbQ8CGP0 126 aa8.65□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.1 ms