Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxa5P09021 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxa5P09021 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxa5P09021 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxa5P09021 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxa5P09021 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxa5P09021 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxa5P09021 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxa5P09021 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hoxa5P09021 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa5P09021 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa5P09021 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa5P09021 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa5P09021 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa5P09021 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa5P09021 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa5P09021 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa5P09021 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa5P09021 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxa5P09021 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa5P09021 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa5P09021 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa5P09021 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxa5P09021 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa5P09021 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa5P09021 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa5P09021 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa5P09021 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa5P09021 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa5P09021 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa5P09021 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa5P09021 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa5P09021 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa5P09021 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa5P09021 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa5P09021 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa5P09021 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa5P09021 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxa5P09021 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa5P09021 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa5P09021 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa5P09021 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa5P09021 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa5P09021 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa5P09021 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa5P09021 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa5P09021 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa5P09021 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa5P09021 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxa5P09021 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa5P09021 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa5P09021 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa5P09021 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa5P09021 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa5P09021 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa5P09021 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa5P09021 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa5P09021 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa5P09021 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa5P09021 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa5P09021 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa5P09021 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa5P09021 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa5P09021 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa5P09021 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa5P09021 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa5P09021 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa5P09021 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa5P09021 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxa5P09021 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa5P09021 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa5P09021 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa5P09021 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa5P09021 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa5P09021 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa5P09021 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa5P09021 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa5P09021 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxa5P09021 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa5P09021 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa5P09021 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa5P09021 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa5P09021 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa5P09021 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa5P09021 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa5P09021 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa5P09021 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa5P09021 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa5P09021 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa5P09021 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxa5P09021 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa5P09021 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa5P09021 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa5P09021 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa5P09021 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa5P09021 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa5P09021 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa5P09021 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa5P09021 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa5P09021 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms