Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Hoxa5P09021 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Hoxa5P09021 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,2■■□□□ 1,78
Hoxa5P09021 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Hoxa5P09021 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Hoxa5P09021 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
Hoxa5P09021 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Hoxa5P09021 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Hoxa5P09021 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,48
Hoxa5P09021 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Hoxa5P09021 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Hoxa5P09021 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Hoxa5P09021 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Hoxa5P09021 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Hoxa5P09021 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Hoxa5P09021 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Hoxa5P09021 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Hoxa5P09021 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Hoxa5P09021 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Hoxa5P09021 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Hoxa5P09021 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Hoxa5P09021 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Hoxa5P09021 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Hoxa5P09021 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,54■■□□□ 1,36
Hoxa5P09021 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Hoxa5P09021 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Hoxa5P09021 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Hoxa5P09021 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,15■■□□□ 1,3
Hoxa5P09021 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Hoxa5P09021 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Hoxa5P09021 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Hoxa5P09021 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Hoxa5P09021 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,77■■□□□ 1,24
Hoxa5P09021 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Hoxa5P09021 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,7■■□□□ 1,22
Hoxa5P09021 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22,68■■□□□ 1,22
Hoxa5P09021 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,66■■□□□ 1,22
Hoxa5P09021 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,22
Hoxa5P09021 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Hoxa5P09021 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Hoxa5P09021 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22,59■■□□□ 1,21
Hoxa5P09021 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Hoxa5P09021 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,53■■□□□ 1,2
Hoxa5P09021 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Hoxa5P09021 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Hoxa5P09021 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Hoxa5P09021 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Hoxa5P09021 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Hoxa5P09021 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,39■■□□□ 1,18
Hoxa5P09021 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Hoxa5P09021 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,36■■□□□ 1,17
Hoxa5P09021 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Hoxa5P09021 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Hoxa5P09021 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,29■■□□□ 1,16
Hoxa5P09021 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Hoxa5P09021 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Hoxa5P09021 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Hoxa5P09021 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Hoxa5P09021 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Hoxa5P09021 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,11■■□□□ 1,13
Hoxa5P09021 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Hoxa5P09021 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Hoxa5P09021 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Hoxa5P09021 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,05■■□□□ 1,12
Hoxa5P09021 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22,03■■□□□ 1,12
Hoxa5P09021 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22■■□□□ 1,11
Hoxa5P09021 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Hoxa5P09021 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,9■■□□□ 1,1
Hoxa5P09021 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Hoxa5P09021 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Hoxa5P09021 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Hoxa5P09021 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Hoxa5P09021 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Hoxa5P09021 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Hoxa5P09021 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Hoxa5P09021 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Hoxa5P09021 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Hoxa5P09021 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Hoxa5P09021 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Hoxa5P09021 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Hoxa5P09021 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Hoxa5P09021 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Hoxa5P09021 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Hoxa5P09021 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Hoxa5P09021 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Hoxa5P09021 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Hoxa5P09021 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Hoxa5P09021 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Hoxa5P09021 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Hoxa5P09021 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Hoxa5P09021 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Hoxa5P09021 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Hoxa5P09021 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Hoxa5P09021 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Hoxa5P09021 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Hoxa5P09021 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21,49■■□□□ 1,03
Hoxa5P09021 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Hoxa5P09021 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Hoxa5P09021 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21,44■■□□□ 1,02
Hoxa5P09021 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,8 ms