Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD0

Gtsf1l, Gametocyte-specific factor 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtsf1lQ9CWD0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtsf1lQ9CWD0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtsf1lQ9CWD0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtsf1lQ9CWD0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtsf1lQ9CWD0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtsf1lQ9CWD0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtsf1lQ9CWD0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtsf1lQ9CWD0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtsf1lQ9CWD0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtsf1lQ9CWD0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtsf1lQ9CWD0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtsf1lQ9CWD0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtsf1lQ9CWD0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtsf1lQ9CWD0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtsf1lQ9CWD0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtsf1lQ9CWD0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtsf1lQ9CWD0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtsf1lQ9CWD0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtsf1lQ9CWD0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtsf1lQ9CWD0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtsf1lQ9CWD0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtsf1lQ9CWD0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtsf1lQ9CWD0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtsf1lQ9CWD0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtsf1lQ9CWD0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtsf1lQ9CWD0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtsf1lQ9CWD0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtsf1lQ9CWD0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtsf1lQ9CWD0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtsf1lQ9CWD0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtsf1lQ9CWD0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtsf1lQ9CWD0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtsf1lQ9CWD0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtsf1lQ9CWD0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtsf1lQ9CWD0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtsf1lQ9CWD0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtsf1lQ9CWD0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtsf1lQ9CWD0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtsf1lQ9CWD0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtsf1lQ9CWD0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtsf1lQ9CWD0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtsf1lQ9CWD0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtsf1lQ9CWD0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtsf1lQ9CWD0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtsf1lQ9CWD0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtsf1lQ9CWD0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtsf1lQ9CWD0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtsf1lQ9CWD0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtsf1lQ9CWD0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtsf1lQ9CWD0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtsf1lQ9CWD0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtsf1lQ9CWD0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtsf1lQ9CWD0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtsf1lQ9CWD0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtsf1lQ9CWD0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtsf1lQ9CWD0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtsf1lQ9CWD0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtsf1lQ9CWD0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtsf1lQ9CWD0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtsf1lQ9CWD0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtsf1lQ9CWD0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtsf1lQ9CWD0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtsf1lQ9CWD0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtsf1lQ9CWD0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtsf1lQ9CWD0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtsf1lQ9CWD0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtsf1lQ9CWD0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtsf1lQ9CWD0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtsf1lQ9CWD0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtsf1lQ9CWD0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtsf1lQ9CWD0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtsf1lQ9CWD0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtsf1lQ9CWD0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtsf1lQ9CWD0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtsf1lQ9CWD0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtsf1lQ9CWD0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtsf1lQ9CWD0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtsf1lQ9CWD0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtsf1lQ9CWD0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtsf1lQ9CWD0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtsf1lQ9CWD0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtsf1lQ9CWD0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtsf1lQ9CWD0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtsf1lQ9CWD0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtsf1lQ9CWD0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtsf1lQ9CWD0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtsf1lQ9CWD0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtsf1lQ9CWD0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtsf1lQ9CWD0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtsf1lQ9CWD0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtsf1lQ9CWD0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtsf1lQ9CWD0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtsf1lQ9CWD0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtsf1lQ9CWD0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtsf1lQ9CWD0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtsf1lQ9CWD0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtsf1lQ9CWD0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtsf1lQ9CWD0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtsf1lQ9CWD0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtsf1lQ9CWD0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms