Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD0

Gtsf1l, Gametocyte-specific factor 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtsf1lQ9CWD0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Gtsf1lQ9CWD0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24,99■■□□□ 1,59
Gtsf1lQ9CWD0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Gtsf1lQ9CWD0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Gtsf1lQ9CWD0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,15■■□□□ 1,46
Gtsf1lQ9CWD0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Gtsf1lQ9CWD0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Gtsf1lQ9CWD0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Gtsf1lQ9CWD0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Gtsf1lQ9CWD0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Gtsf1lQ9CWD0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Gtsf1lQ9CWD0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Gtsf1lQ9CWD0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Gtsf1lQ9CWD0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22,76■■□□□ 1,23
Gtsf1lQ9CWD0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Gtsf1lQ9CWD0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Gtsf1lQ9CWD0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Gtsf1lQ9CWD0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22,65■■□□□ 1,22
Gtsf1lQ9CWD0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Gtsf1lQ9CWD0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Gtsf1lQ9CWD0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Gtsf1lQ9CWD0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Gtsf1lQ9CWD0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Gtsf1lQ9CWD0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Gtsf1lQ9CWD0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22,28■■□□□ 1,16
Gtsf1lQ9CWD0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Gtsf1lQ9CWD0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Gtsf1lQ9CWD0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Gtsf1lQ9CWD0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,04■■□□□ 1,12
Gtsf1lQ9CWD0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Gtsf1lQ9CWD0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1,11
Gtsf1lQ9CWD0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Gtsf1lQ9CWD0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Gtsf1lQ9CWD0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Gtsf1lQ9CWD0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Gtsf1lQ9CWD0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,83■■□□□ 1,08
Gtsf1lQ9CWD0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Gtsf1lQ9CWD0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Gtsf1lQ9CWD0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Gtsf1lQ9CWD0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Gtsf1lQ9CWD0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21,64■■□□□ 1,05
Gtsf1lQ9CWD0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,64■■□□□ 1,05
Gtsf1lQ9CWD0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,62■■□□□ 1,05
Gtsf1lQ9CWD0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Gtsf1lQ9CWD0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Gtsf1lQ9CWD0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Gtsf1lQ9CWD0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Gtsf1lQ9CWD0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Gtsf1lQ9CWD0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Gtsf1lQ9CWD0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Gtsf1lQ9CWD0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Gtsf1lQ9CWD0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Gtsf1lQ9CWD0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21,29■■□□□ 1
Gtsf1lQ9CWD0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Gtsf1lQ9CWD0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Gtsf1lQ9CWD0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Gtsf1lQ9CWD0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Gtsf1lQ9CWD0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Gtsf1lQ9CWD0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,11■□□□□ 0,97
Gtsf1lQ9CWD0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,96
Gtsf1lQ9CWD0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Gtsf1lQ9CWD0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Gtsf1lQ9CWD0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Gtsf1lQ9CWD0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Gtsf1lQ9CWD0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Gtsf1lQ9CWD0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Gtsf1lQ9CWD0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,01■□□□□ 0,95
Gtsf1lQ9CWD0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Gtsf1lQ9CWD0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Gtsf1lQ9CWD0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Gtsf1lQ9CWD0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Gtsf1lQ9CWD0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Gtsf1lQ9CWD0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Gtsf1lQ9CWD0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Gtsf1lQ9CWD0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Gtsf1lQ9CWD0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Gtsf1lQ9CWD0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Gtsf1lQ9CWD0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Gtsf1lQ9CWD0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20,8■□□□□ 0,92
Gtsf1lQ9CWD0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Gtsf1lQ9CWD0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Gtsf1lQ9CWD0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Gtsf1lQ9CWD0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Gtsf1lQ9CWD0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Gtsf1lQ9CWD0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Gtsf1lQ9CWD0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Gtsf1lQ9CWD0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Gtsf1lQ9CWD0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Gtsf1lQ9CWD0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Gtsf1lQ9CWD0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Gtsf1lQ9CWD0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Gtsf1lQ9CWD0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Gtsf1lQ9CWD0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20,51■□□□□ 0,87
Gtsf1lQ9CWD0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Gtsf1lQ9CWD0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Gtsf1lQ9CWD0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Gtsf1lQ9CWD0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Gtsf1lQ9CWD0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Gtsf1lQ9CWD0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Gtsf1lQ9CWD0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms