Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprqP0C5E4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprqP0C5E4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprqP0C5E4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprqP0C5E4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprqP0C5E4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprqP0C5E4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprqP0C5E4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprqP0C5E4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprqP0C5E4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprqP0C5E4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PtprqP0C5E4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprqP0C5E4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprqP0C5E4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprqP0C5E4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprqP0C5E4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprqP0C5E4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprqP0C5E4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprqP0C5E4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprqP0C5E4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprqP0C5E4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprqP0C5E4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprqP0C5E4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprqP0C5E4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprqP0C5E4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprqP0C5E4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprqP0C5E4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprqP0C5E4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprqP0C5E4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprqP0C5E4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprqP0C5E4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprqP0C5E4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprqP0C5E4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprqP0C5E4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprqP0C5E4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprqP0C5E4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprqP0C5E4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprqP0C5E4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprqP0C5E4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprqP0C5E4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprqP0C5E4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprqP0C5E4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprqP0C5E4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprqP0C5E4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprqP0C5E4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprqP0C5E4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprqP0C5E4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprqP0C5E4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprqP0C5E4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprqP0C5E4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprqP0C5E4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprqP0C5E4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprqP0C5E4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprqP0C5E4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprqP0C5E4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprqP0C5E4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprqP0C5E4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprqP0C5E4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprqP0C5E4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprqP0C5E4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprqP0C5E4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprqP0C5E4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprqP0C5E4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprqP0C5E4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprqP0C5E4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprqP0C5E4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprqP0C5E4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprqP0C5E4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprqP0C5E4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprqP0C5E4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprqP0C5E4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprqP0C5E4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprqP0C5E4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprqP0C5E4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprqP0C5E4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprqP0C5E4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprqP0C5E4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprqP0C5E4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprqP0C5E4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprqP0C5E4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprqP0C5E4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprqP0C5E4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprqP0C5E4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprqP0C5E4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprqP0C5E4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprqP0C5E4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprqP0C5E4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprqP0C5E4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprqP0C5E4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprqP0C5E4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprqP0C5E4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprqP0C5E4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprqP0C5E4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprqP0C5E4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprqP0C5E4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprqP0C5E4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprqP0C5E4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprqP0C5E4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprqP0C5E4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprqP0C5E4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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