Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR36

Gkn1, Gastrokine-1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn1Q9CR36 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gkn1Q9CR36 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gkn1Q9CR36 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gkn1Q9CR36 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gkn1Q9CR36 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gkn1Q9CR36 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gkn1Q9CR36 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gkn1Q9CR36 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gkn1Q9CR36 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gkn1Q9CR36 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gkn1Q9CR36 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gkn1Q9CR36 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gkn1Q9CR36 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gkn1Q9CR36 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gkn1Q9CR36 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gkn1Q9CR36 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gkn1Q9CR36 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gkn1Q9CR36 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gkn1Q9CR36 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gkn1Q9CR36 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gkn1Q9CR36 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gkn1Q9CR36 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gkn1Q9CR36 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gkn1Q9CR36 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gkn1Q9CR36 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gkn1Q9CR36 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gkn1Q9CR36 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gkn1Q9CR36 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gkn1Q9CR36 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gkn1Q9CR36 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gkn1Q9CR36 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gkn1Q9CR36 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gkn1Q9CR36 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gkn1Q9CR36 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gkn1Q9CR36 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gkn1Q9CR36 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gkn1Q9CR36 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gkn1Q9CR36 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gkn1Q9CR36 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gkn1Q9CR36 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gkn1Q9CR36 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gkn1Q9CR36 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gkn1Q9CR36 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gkn1Q9CR36 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gkn1Q9CR36 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gkn1Q9CR36 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkn1Q9CR36 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gkn1Q9CR36 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gkn1Q9CR36 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gkn1Q9CR36 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gkn1Q9CR36 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Gkn1Q9CR36 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gkn1Q9CR36 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gkn1Q9CR36 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gkn1Q9CR36 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gkn1Q9CR36 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gkn1Q9CR36 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gkn1Q9CR36 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gkn1Q9CR36 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gkn1Q9CR36 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gkn1Q9CR36 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gkn1Q9CR36 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gkn1Q9CR36 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gkn1Q9CR36 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gkn1Q9CR36 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gkn1Q9CR36 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gkn1Q9CR36 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gkn1Q9CR36 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gkn1Q9CR36 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gkn1Q9CR36 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gkn1Q9CR36 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gkn1Q9CR36 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gkn1Q9CR36 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gkn1Q9CR36 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gkn1Q9CR36 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gkn1Q9CR36 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gkn1Q9CR36 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gkn1Q9CR36 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gkn1Q9CR36 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gkn1Q9CR36 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gkn1Q9CR36 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gkn1Q9CR36 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gkn1Q9CR36 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gkn1Q9CR36 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gkn1Q9CR36 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gkn1Q9CR36 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gkn1Q9CR36 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gkn1Q9CR36 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gkn1Q9CR36 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gkn1Q9CR36 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gkn1Q9CR36 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gkn1Q9CR36 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gkn1Q9CR36 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gkn1Q9CR36 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gkn1Q9CR36 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gkn1Q9CR36 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gkn1Q9CR36 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gkn1Q9CR36 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gkn1Q9CR36 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gkn1Q9CR36 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms