Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR36

Gkn1, Gastrokine-1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn1Q9CR36 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gkn1Q9CR36 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
Gkn1Q9CR36 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Gkn1Q9CR36 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Gkn1Q9CR36 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,66■■□□□ 1,38
Gkn1Q9CR36 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Gkn1Q9CR36 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Gkn1Q9CR36 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Gkn1Q9CR36 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Gkn1Q9CR36 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Gkn1Q9CR36 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Gkn1Q9CR36 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Gkn1Q9CR36 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22,68■■□□□ 1,22
Gkn1Q9CR36 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Gkn1Q9CR36 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Gkn1Q9CR36 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Gkn1Q9CR36 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22,52■■□□□ 1,2
Gkn1Q9CR36 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22,26■■□□□ 1,15
Gkn1Q9CR36 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Gkn1Q9CR36 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Gkn1Q9CR36 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Gkn1Q9CR36 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Gkn1Q9CR36 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Gkn1Q9CR36 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Gkn1Q9CR36 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Gkn1Q9CR36 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Gkn1Q9CR36 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Gkn1Q9CR36 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Gkn1Q9CR36 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Gkn1Q9CR36 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Gkn1Q9CR36 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Gkn1Q9CR36 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21,79■■□□□ 1,08
Gkn1Q9CR36 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Gkn1Q9CR36 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Gkn1Q9CR36 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,64■■□□□ 1,05
Gkn1Q9CR36 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Gkn1Q9CR36 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Gkn1Q9CR36 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21,51■■□□□ 1,03
Gkn1Q9CR36 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,46■■□□□ 1,03
Gkn1Q9CR36 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Gkn1Q9CR36 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Gkn1Q9CR36 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Gkn1Q9CR36 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Gkn1Q9CR36 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,32■■□□□ 1
Gkn1Q9CR36 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Gkn1Q9CR36 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Gkn1Q9CR36 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Gkn1Q9CR36 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,15■□□□□ 0,98
Gkn1Q9CR36 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Gkn1Q9CR36 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Gkn1Q9CR36 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,08■□□□□ 0,96
Gkn1Q9CR36 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Gkn1Q9CR36 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Gkn1Q9CR36 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Gkn1Q9CR36 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Gkn1Q9CR36 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Gkn1Q9CR36 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Gkn1Q9CR36 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,92■□□□□ 0,94
Gkn1Q9CR36 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Gkn1Q9CR36 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Gkn1Q9CR36 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20,9■□□□□ 0,94
Gkn1Q9CR36 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Gkn1Q9CR36 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,86■□□□□ 0,93
Gkn1Q9CR36 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Gkn1Q9CR36 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Gkn1Q9CR36 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Gkn1Q9CR36 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Gkn1Q9CR36 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Gkn1Q9CR36 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Gkn1Q9CR36 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Gkn1Q9CR36 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Gkn1Q9CR36 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Gkn1Q9CR36 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Gkn1Q9CR36 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Gkn1Q9CR36 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Gkn1Q9CR36 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Gkn1Q9CR36 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Gkn1Q9CR36 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Gkn1Q9CR36 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Gkn1Q9CR36 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Gkn1Q9CR36 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Gkn1Q9CR36 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Gkn1Q9CR36 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Gkn1Q9CR36 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Gkn1Q9CR36 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Gkn1Q9CR36 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,31■□□□□ 0,84
Gkn1Q9CR36 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Gkn1Q9CR36 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Gkn1Q9CR36 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Gkn1Q9CR36 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20,2■□□□□ 0,82
Gkn1Q9CR36 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Gkn1Q9CR36 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Gkn1Q9CR36 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,15■□□□□ 0,82
Gkn1Q9CR36 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Gkn1Q9CR36 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Gkn1Q9CR36 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Gkn1Q9CR36 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Gkn1Q9CR36 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Gkn1Q9CR36 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Gkn1Q9CR36 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms