RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 NischQ80TM9 1593 aa24.05■■□□□ 1.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa23.57■■□□□ 1.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abcc9P70170 1546 aa23.18■■□□□ 1.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abcc8B2RUS7 1588 aa22.94■■□□□ 1.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rhox8Q6VSS7 320 aa22.2■■□□□ 1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 ScribQ80U72 1612 aa21.61■■□□□ 1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kdm5dQ62240 1548 aa21.21■□□□□ 0.99
Herc3-201ENSMUST00000031823 NacadQ5SWP3 1504 aa21.21■□□□□ 0.99
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dcaf1Q80TR8 1506 aa21.19■□□□□ 0.98
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa21■□□□□ 0.95
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sycp2Q9CUU3 1500 aa20.71■□□□□ 0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Baz1aO88379 1555 aa20.7■□□□□ 0.9
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa20.6■□□□□ 0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rtl1Q7M732 1744 aa20.43■□□□□ 0.86
Herc3-201ENSMUST00000031823 Crybg2B7ZCC2 1516 aa20.41■□□□□ 0.86
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc180J3QNE4 1664 aa20.39■□□□□ 0.85
Herc3-201ENSMUST00000031823 BicraF8VPZ9 1578 aa20.23■□□□□ 0.83
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim41Q5NCC3 630 aa20.16■□□□□ 0.82
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smarca2Q6DIC0 1577 aa20.1■□□□□ 0.81
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa19.97■□□□□ 0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
Herc3-201ENSMUST00000031823 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cngb1E1AZ71 1325 aa19.79■□□□□ 0.76
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.75
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
Herc3-201ENSMUST00000031823 CftrP26361 1476 aa19.62■□□□□ 0.73
Herc3-201ENSMUST00000031823 Synj1Q8CHC4 1574 aa19.58■□□□□ 0.73
Herc3-201ENSMUST00000031823 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa19.51■□□□□ 0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 HrcG5E8J6 738 aa19.5■□□□□ 0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ercc6F8VPZ5 1481 aa19.43■□□□□ 0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa19.41■□□□□ 0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Golga3P55937 1487 aa19.38■□□□□ 0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Chic1Q8CBW7 227 aa19.25■□□□□ 0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Frmpd1A2AKB4 1549 aa19.24■□□□□ 0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gab3Q8BSM5 595 aa19.21■□□□□ 0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ubl4bQ9CQ84 188 aa19.21■□□□□ 0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr62Q3U3T8 1523 aa19.18■□□□□ 0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Il27Q8K3I6 234 aa19.14■□□□□ 0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa19.13■□□□□ 0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa19.09■□□□□ 0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kif15Q6P9L6 1387 aa19.08■□□□□ 0.64
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cep164Q5DU05 1446 aa19.05■□□□□ 0.64
Herc3-201ENSMUST00000031823 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa18.98■□□□□ 0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fmn1Q05860 1466 aa18.97■□□□□ 0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Top2bQ64511 1612 aa18.96■□□□□ 0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Npm2Q80W85 207 aa18.91■□□□□ 0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cux2P70298 1426 aa18.84■□□□□ 0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam135aQ6NS59 1506 aa18.81■□□□□ 0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zeb1Q64318 1117 aa18.77■□□□□ 0.59
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc18Q640L5 1455 aa18.77■□□□□ 0.59
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myt1lP97500 1187 aa18.76■□□□□ 0.59
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lamc3Q9R0B6 1581 aa18.73■□□□□ 0.59
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
Herc3-201ENSMUST00000031823 Unc13aQ4KUS2 1712 aa18.68■□□□□ 0.58
Herc3-201ENSMUST00000031823 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrc2Q64449 1479 aa18.61■□□□□ 0.57
Herc3-201ENSMUST00000031823 TnnQ80Z71 1560 aa18.6■□□□□ 0.57
Herc3-201ENSMUST00000031823 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
Herc3-201ENSMUST00000031823 Camsap1A2AHC3 1581 aa18.54■□□□□ 0.56
Herc3-201ENSMUST00000031823 Baz1bQ9Z277 1479 aa18.51■□□□□ 0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa18.45■□□□□ 0.54
Herc3-201ENSMUST00000031823 Grin2bQ01097 1482 aa18.44■□□□□ 0.54
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cep162Q6ZQ06 1403 aa18.42■□□□□ 0.54
Herc3-201ENSMUST00000031823 PtprkP35822 1457 aa18.41■□□□□ 0.54
Herc3-201ENSMUST00000031823 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 NrkQ9R0G8 1455 aa18.38■□□□□ 0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Duox2A2AQ99 1517 aa18.36■□□□□ 0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Shroom4Q1W617 1475 aa18.36■□□□□ 0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Efcab5A0JP43 1406 aa18.35■□□□□ 0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa18.27■□□□□ 0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Clip1Q922J3 1391 aa18.25■□□□□ 0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kif21aQ9QXL2 1672 aa18.24■□□□□ 0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plb1Q3TTY0 1478 aa18.23■□□□□ 0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgap35Q91YM2 1499 aa18.22■□□□□ 0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Crocc2F6XLV1 1638 aa18.2■□□□□ 0.5
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rad54l2Q99NG0 1466 aa18.18■□□□□ 0.5
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa18.16■□□□□ 0.5
Herc3-201ENSMUST00000031823 Setd5Q5XJV7 1441 aa18.13■□□□□ 0.49
Herc3-201ENSMUST00000031823 UbtfP25976 765 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
Herc3-201ENSMUST00000031823 Carmil1Q6EDY6 1374 aa18.11■□□□□ 0.49
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa18.1■□□□□ 0.49
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eea1Q8BL66 1411 aa18.09■□□□□ 0.49
Herc3-201ENSMUST00000031823 Samd9lQ69Z37 1561 aa18.08■□□□□ 0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Map3k1P53349 1493 aa18.08■□□□□ 0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ift140E9PY46 1464 aa18.03■□□□□ 0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 SynmQ70IV5 1561 aa18.01■□□□□ 0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Disp1Q3TDN0 1521 aa18■□□□□ 0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa17.98■□□□□ 0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lmod2Q3UHZ5 550 aa17.97■□□□□ 0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Grin2aP35436 1464 aa17.96■□□□□ 0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgap27A2AB59 869 aa17.96■□□□□ 0.47
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