Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8P7

Gm10300, Predicted gene 10300 (Fragment), mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10300Q8C8P7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm10300Q8C8P7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm10300Q8C8P7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm10300Q8C8P7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm10300Q8C8P7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm10300Q8C8P7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10300Q8C8P7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10300Q8C8P7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10300Q8C8P7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm10300Q8C8P7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm10300Q8C8P7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm10300Q8C8P7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm10300Q8C8P7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm10300Q8C8P7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm10300Q8C8P7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10300Q8C8P7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm10300Q8C8P7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm10300Q8C8P7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm10300Q8C8P7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm10300Q8C8P7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm10300Q8C8P7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm10300Q8C8P7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm10300Q8C8P7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm10300Q8C8P7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm10300Q8C8P7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm10300Q8C8P7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10300Q8C8P7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10300Q8C8P7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10300Q8C8P7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm10300Q8C8P7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm10300Q8C8P7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10300Q8C8P7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm10300Q8C8P7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10300Q8C8P7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10300Q8C8P7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10300Q8C8P7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10300Q8C8P7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm10300Q8C8P7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10300Q8C8P7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10300Q8C8P7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10300Q8C8P7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm10300Q8C8P7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm10300Q8C8P7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm10300Q8C8P7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm10300Q8C8P7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm10300Q8C8P7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm10300Q8C8P7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm10300Q8C8P7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm10300Q8C8P7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10300Q8C8P7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm10300Q8C8P7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm10300Q8C8P7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10300Q8C8P7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10300Q8C8P7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm10300Q8C8P7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10300Q8C8P7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10300Q8C8P7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10300Q8C8P7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm10300Q8C8P7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm10300Q8C8P7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm10300Q8C8P7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm10300Q8C8P7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10300Q8C8P7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10300Q8C8P7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10300Q8C8P7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10300Q8C8P7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm10300Q8C8P7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm10300Q8C8P7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm10300Q8C8P7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm10300Q8C8P7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm10300Q8C8P7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm10300Q8C8P7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm10300Q8C8P7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm10300Q8C8P7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm10300Q8C8P7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm10300Q8C8P7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm10300Q8C8P7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10300Q8C8P7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm10300Q8C8P7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm10300Q8C8P7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm10300Q8C8P7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm10300Q8C8P7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm10300Q8C8P7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm10300Q8C8P7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm10300Q8C8P7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm10300Q8C8P7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm10300Q8C8P7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm10300Q8C8P7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm10300Q8C8P7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm10300Q8C8P7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm10300Q8C8P7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm10300Q8C8P7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm10300Q8C8P7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm10300Q8C8P7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm10300Q8C8P7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm10300Q8C8P7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm10300Q8C8P7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm10300Q8C8P7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm10300Q8C8P7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm10300Q8C8P7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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