Protein–RNA interactions for Protein: Q60997

Dmbt1, Deleted in malignant brain tumors 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dmbt1Q60997 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Dmbt1Q60997 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dmbt1Q60997 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dmbt1Q60997 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Dmbt1Q60997 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Dmbt1Q60997 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Dmbt1Q60997 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dmbt1Q60997 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dmbt1Q60997 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dmbt1Q60997 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dmbt1Q60997 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dmbt1Q60997 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dmbt1Q60997 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dmbt1Q60997 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dmbt1Q60997 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Dmbt1Q60997 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dmbt1Q60997 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dmbt1Q60997 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dmbt1Q60997 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Dmbt1Q60997 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmbt1Q60997 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dmbt1Q60997 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dmbt1Q60997 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dmbt1Q60997 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dmbt1Q60997 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dmbt1Q60997 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dmbt1Q60997 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dmbt1Q60997 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dmbt1Q60997 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Dmbt1Q60997 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dmbt1Q60997 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dmbt1Q60997 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Dmbt1Q60997 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dmbt1Q60997 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dmbt1Q60997 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dmbt1Q60997 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dmbt1Q60997 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dmbt1Q60997 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dmbt1Q60997 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dmbt1Q60997 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dmbt1Q60997 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dmbt1Q60997 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dmbt1Q60997 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Dmbt1Q60997 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dmbt1Q60997 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dmbt1Q60997 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dmbt1Q60997 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dmbt1Q60997 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dmbt1Q60997 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dmbt1Q60997 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dmbt1Q60997 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dmbt1Q60997 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dmbt1Q60997 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dmbt1Q60997 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Dmbt1Q60997 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dmbt1Q60997 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dmbt1Q60997 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dmbt1Q60997 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dmbt1Q60997 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dmbt1Q60997 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dmbt1Q60997 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dmbt1Q60997 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dmbt1Q60997 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dmbt1Q60997 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Dmbt1Q60997 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dmbt1Q60997 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dmbt1Q60997 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Dmbt1Q60997 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dmbt1Q60997 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dmbt1Q60997 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Dmbt1Q60997 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dmbt1Q60997 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Dmbt1Q60997 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dmbt1Q60997 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dmbt1Q60997 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dmbt1Q60997 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dmbt1Q60997 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dmbt1Q60997 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dmbt1Q60997 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dmbt1Q60997 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dmbt1Q60997 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dmbt1Q60997 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dmbt1Q60997 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dmbt1Q60997 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dmbt1Q60997 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dmbt1Q60997 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dmbt1Q60997 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dmbt1Q60997 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dmbt1Q60997 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dmbt1Q60997 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dmbt1Q60997 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Dmbt1Q60997 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dmbt1Q60997 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dmbt1Q60997 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dmbt1Q60997 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dmbt1Q60997 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Dmbt1Q60997 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dmbt1Q60997 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dmbt1Q60997 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dmbt1Q60997 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms