Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI5

Ppbp, Chemokine (C-X-C motif) ligand 7, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpbpQ9EQI5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,01■■■□□ 2,07
PpbpQ9EQI5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
PpbpQ9EQI5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
PpbpQ9EQI5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
PpbpQ9EQI5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
PpbpQ9EQI5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,56■■□□□ 1,52
PpbpQ9EQI5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
PpbpQ9EQI5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,22■■□□□ 1,47
PpbpQ9EQI5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,97■■□□□ 1,43
PpbpQ9EQI5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
PpbpQ9EQI5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
PpbpQ9EQI5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,67■■□□□ 1,38
PpbpQ9EQI5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,64■■□□□ 1,37
PpbpQ9EQI5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
PpbpQ9EQI5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
PpbpQ9EQI5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,43■■□□□ 1,34
PpbpQ9EQI5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
PpbpQ9EQI5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
PpbpQ9EQI5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
PpbpQ9EQI5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22,85■■□□□ 1,25
PpbpQ9EQI5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
PpbpQ9EQI5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
PpbpQ9EQI5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
PpbpQ9EQI5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,7■■□□□ 1,22
PpbpQ9EQI5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,67■■□□□ 1,22
PpbpQ9EQI5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
PpbpQ9EQI5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
PpbpQ9EQI5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,59■■□□□ 1,21
PpbpQ9EQI5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
PpbpQ9EQI5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
PpbpQ9EQI5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
PpbpQ9EQI5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
PpbpQ9EQI5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
PpbpQ9EQI5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
PpbpQ9EQI5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
PpbpQ9EQI5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
PpbpQ9EQI5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,44■■□□□ 1,18
PpbpQ9EQI5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,36■■□□□ 1,17
PpbpQ9EQI5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
PpbpQ9EQI5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
PpbpQ9EQI5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,31■■□□□ 1,16
PpbpQ9EQI5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
PpbpQ9EQI5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
PpbpQ9EQI5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
PpbpQ9EQI5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
PpbpQ9EQI5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
PpbpQ9EQI5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,1■■□□□ 1,13
PpbpQ9EQI5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,07■■□□□ 1,12
PpbpQ9EQI5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
PpbpQ9EQI5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
PpbpQ9EQI5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
PpbpQ9EQI5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,97■■□□□ 1,11
PpbpQ9EQI5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
PpbpQ9EQI5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,94■■□□□ 1,1
PpbpQ9EQI5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
PpbpQ9EQI5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
PpbpQ9EQI5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
PpbpQ9EQI5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,73■■□□□ 1,07
PpbpQ9EQI5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
PpbpQ9EQI5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21,7■■□□□ 1,06
PpbpQ9EQI5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,65■■□□□ 1,06
PpbpQ9EQI5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
PpbpQ9EQI5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21,61■■□□□ 1,05
PpbpQ9EQI5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21,58■■□□□ 1,05
PpbpQ9EQI5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,54■■□□□ 1,04
PpbpQ9EQI5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
PpbpQ9EQI5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21,52■■□□□ 1,04
PpbpQ9EQI5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
PpbpQ9EQI5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
PpbpQ9EQI5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
PpbpQ9EQI5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,41■■□□□ 1,02
PpbpQ9EQI5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,39■■□□□ 1,02
PpbpQ9EQI5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21,37■■□□□ 1,01
PpbpQ9EQI5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,32■■□□□ 1
PpbpQ9EQI5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
PpbpQ9EQI5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
PpbpQ9EQI5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
PpbpQ9EQI5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
PpbpQ9EQI5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
PpbpQ9EQI5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
PpbpQ9EQI5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21,16■□□□□ 0,98
PpbpQ9EQI5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,13■□□□□ 0,97
PpbpQ9EQI5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
PpbpQ9EQI5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
PpbpQ9EQI5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
PpbpQ9EQI5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,09■□□□□ 0,97
PpbpQ9EQI5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
PpbpQ9EQI5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
PpbpQ9EQI5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
PpbpQ9EQI5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,05■□□□□ 0,96
PpbpQ9EQI5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
PpbpQ9EQI5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
PpbpQ9EQI5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
PpbpQ9EQI5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,03■□□□□ 0,96
PpbpQ9EQI5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,03■□□□□ 0,96
PpbpQ9EQI5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
PpbpQ9EQI5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,02■□□□□ 0,96
PpbpQ9EQI5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
PpbpQ9EQI5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
PpbpQ9EQI5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
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