Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8Z1

Mycb, Protein B-Myc, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MycbQ6P8Z1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
MycbQ6P8Z1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
MycbQ6P8Z1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
MycbQ6P8Z1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
MycbQ6P8Z1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,17■■□□□ 1,46
MycbQ6P8Z1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
MycbQ6P8Z1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
MycbQ6P8Z1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,88■■□□□ 1,41
MycbQ6P8Z1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,66■■□□□ 1,38
MycbQ6P8Z1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
MycbQ6P8Z1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,34■■□□□ 1,33
MycbQ6P8Z1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
MycbQ6P8Z1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,17■■□□□ 1,3
MycbQ6P8Z1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
MycbQ6P8Z1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22,74■■□□□ 1,23
MycbQ6P8Z1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
MycbQ6P8Z1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
MycbQ6P8Z1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
MycbQ6P8Z1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22,55■■□□□ 1,2
MycbQ6P8Z1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
MycbQ6P8Z1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
MycbQ6P8Z1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
MycbQ6P8Z1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
MycbQ6P8Z1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
MycbQ6P8Z1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
MycbQ6P8Z1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
MycbQ6P8Z1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
MycbQ6P8Z1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
MycbQ6P8Z1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
MycbQ6P8Z1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
MycbQ6P8Z1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
MycbQ6P8Z1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
MycbQ6P8Z1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
MycbQ6P8Z1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
MycbQ6P8Z1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,12■■□□□ 1,13
MycbQ6P8Z1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,11■■□□□ 1,13
MycbQ6P8Z1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
MycbQ6P8Z1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21,91■■□□□ 1,1
MycbQ6P8Z1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21,91■■□□□ 1,1
MycbQ6P8Z1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,87■■□□□ 1,09
MycbQ6P8Z1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
MycbQ6P8Z1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
MycbQ6P8Z1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
MycbQ6P8Z1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
MycbQ6P8Z1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
MycbQ6P8Z1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21,48■■□□□ 1,03
MycbQ6P8Z1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21,48■■□□□ 1,03
MycbQ6P8Z1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,47■■□□□ 1,03
MycbQ6P8Z1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
MycbQ6P8Z1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,44■■□□□ 1,02
MycbQ6P8Z1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
MycbQ6P8Z1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
MycbQ6P8Z1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,33■■□□□ 1,01
MycbQ6P8Z1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
MycbQ6P8Z1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,29■■□□□ 1
MycbQ6P8Z1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
MycbQ6P8Z1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
MycbQ6P8Z1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
MycbQ6P8Z1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,22■□□□□ 0,99
MycbQ6P8Z1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
MycbQ6P8Z1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
MycbQ6P8Z1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
MycbQ6P8Z1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
MycbQ6P8Z1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,12■□□□□ 0,97
MycbQ6P8Z1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21,1■□□□□ 0,97
MycbQ6P8Z1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
MycbQ6P8Z1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
MycbQ6P8Z1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,06■□□□□ 0,96
MycbQ6P8Z1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
MycbQ6P8Z1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
MycbQ6P8Z1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
MycbQ6P8Z1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
MycbQ6P8Z1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20,92■□□□□ 0,94
MycbQ6P8Z1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,91■□□□□ 0,94
MycbQ6P8Z1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
MycbQ6P8Z1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,9■□□□□ 0,94
MycbQ6P8Z1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
MycbQ6P8Z1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20,88■□□□□ 0,93
MycbQ6P8Z1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
MycbQ6P8Z1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,85■□□□□ 0,93
MycbQ6P8Z1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20,85■□□□□ 0,93
MycbQ6P8Z1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,93
MycbQ6P8Z1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20,82■□□□□ 0,92
MycbQ6P8Z1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
MycbQ6P8Z1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
MycbQ6P8Z1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,74■□□□□ 0,91
MycbQ6P8Z1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
MycbQ6P8Z1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
MycbQ6P8Z1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,68■□□□□ 0,9
MycbQ6P8Z1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
MycbQ6P8Z1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
MycbQ6P8Z1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
MycbQ6P8Z1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20,61■□□□□ 0,89
MycbQ6P8Z1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20,57■□□□□ 0,88
MycbQ6P8Z1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
MycbQ6P8Z1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
MycbQ6P8Z1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
MycbQ6P8Z1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
MycbQ6P8Z1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,51■□□□□ 0,87
MycbQ6P8Z1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,1 ms