Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W7

Cd164l2, CD164 sialomucin-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd164l2Q9D6W7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cd164l2Q9D6W7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cd164l2Q9D6W7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cd164l2Q9D6W7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cd164l2Q9D6W7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd164l2Q9D6W7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd164l2Q9D6W7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd164l2Q9D6W7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd164l2Q9D6W7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd164l2Q9D6W7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd164l2Q9D6W7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd164l2Q9D6W7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd164l2Q9D6W7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd164l2Q9D6W7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd164l2Q9D6W7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd164l2Q9D6W7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd164l2Q9D6W7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd164l2Q9D6W7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd164l2Q9D6W7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd164l2Q9D6W7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd164l2Q9D6W7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd164l2Q9D6W7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd164l2Q9D6W7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd164l2Q9D6W7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd164l2Q9D6W7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd164l2Q9D6W7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd164l2Q9D6W7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd164l2Q9D6W7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd164l2Q9D6W7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd164l2Q9D6W7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd164l2Q9D6W7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd164l2Q9D6W7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd164l2Q9D6W7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd164l2Q9D6W7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd164l2Q9D6W7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd164l2Q9D6W7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd164l2Q9D6W7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd164l2Q9D6W7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd164l2Q9D6W7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd164l2Q9D6W7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd164l2Q9D6W7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd164l2Q9D6W7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd164l2Q9D6W7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd164l2Q9D6W7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd164l2Q9D6W7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd164l2Q9D6W7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd164l2Q9D6W7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd164l2Q9D6W7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd164l2Q9D6W7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cd164l2Q9D6W7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd164l2Q9D6W7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd164l2Q9D6W7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd164l2Q9D6W7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd164l2Q9D6W7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd164l2Q9D6W7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd164l2Q9D6W7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd164l2Q9D6W7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd164l2Q9D6W7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd164l2Q9D6W7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd164l2Q9D6W7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd164l2Q9D6W7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd164l2Q9D6W7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd164l2Q9D6W7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd164l2Q9D6W7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd164l2Q9D6W7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd164l2Q9D6W7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd164l2Q9D6W7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd164l2Q9D6W7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd164l2Q9D6W7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd164l2Q9D6W7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd164l2Q9D6W7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd164l2Q9D6W7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd164l2Q9D6W7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd164l2Q9D6W7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd164l2Q9D6W7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd164l2Q9D6W7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd164l2Q9D6W7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd164l2Q9D6W7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd164l2Q9D6W7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd164l2Q9D6W7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd164l2Q9D6W7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd164l2Q9D6W7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd164l2Q9D6W7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd164l2Q9D6W7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd164l2Q9D6W7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd164l2Q9D6W7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd164l2Q9D6W7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd164l2Q9D6W7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cd164l2Q9D6W7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cd164l2Q9D6W7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cd164l2Q9D6W7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd164l2Q9D6W7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd164l2Q9D6W7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd164l2Q9D6W7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd164l2Q9D6W7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd164l2Q9D6W7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd164l2Q9D6W7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd164l2Q9D6W7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd164l2Q9D6W7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd164l2Q9D6W7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms