RNA–Protein interactions for RNA: YJR130C

STR2, Transcript of Cystathionine gamma-synthase, converts cysteine into cystathionine, yeast

Gene STR2, Length 1,920 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STR2	YJR130C	STE14	P32584	239 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
STR2	YJR130C	YBR259W	P38338	688 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	UME6	P39001	836 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	RSM25	P40496	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	BUD8	P41698	603 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	PEF1	P53238	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	SDH5	Q08230	162 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	YLR415C	O13578	112 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	PAH1	P32567	862 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	KAE1	P36132	386 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	MET12	P46151	657 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	COX18	P53239	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	MDR1	P53258	950 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	INP2	Q03824	705 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	AXL2	P38928	823 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	YIR042C	P40586	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	CTF18	P49956	741 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	BTN2	P53286	410 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	HST1	P53685	503 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	VPS36	Q06696	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	VPS15	P22219	1454 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	MRP7	P12687	371 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
STR2	YJR130C	FAR1	P21268	830 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	MSS4	P38994	779 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	SHC1	P39000	512 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	VPS20	Q04272	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	CRD1	Q07560	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	AAD4	Q07747	329 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	AUS1	Q08409	1394 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	GDB1	Q06625	1536 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	HIS5	P07172	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	PCK1	P10963	549 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	PET123	P17558	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	CSE1	P33307	960 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	IFA38	P38286	347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	YEL068C	P39977	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	YER010C	P40011	234 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	YNL195C	P40168	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	CBK1	P53894	756 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	ORC3	P54790	616 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	ARA2	Q04212	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	TRM8	Q12009	286 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	DNF2	Q12675	1612 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	PSK1	P31374	1356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	URA3	P03962	267 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	HMG2	P12684	1045 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	AAC3	P18238	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	SWC3	P31376	625 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	YBR138C	P38277	524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	YHR112C	P38716	378 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	PRM2	P40534	656 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	BIT61	P47041	543 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	GCV2	P49095	1034 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	DSL1	P53847	754 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	CYC7	P00045	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	SPE2	P21182	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	ARG1	P22768	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	RIT1	P23796	513 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	KIN82	P25341	720 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	PRE4	P30657	266 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	KDX1	P36005	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	UBP13	P38187	747 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	VTC2	P43585	828 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	TAH11	P47112	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	NCS6	P53088	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	SPO1	P53541	631 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STR2	YJR130C	SEC5	P89102	971 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.9 ms