RNA–Protein interactions for RNA: YPR013C

CMR3, Transcript of Putative zinc finger protein, yeast

Gene CMR3, Length 954 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CMR3	YPR013C	RPP1	P38786	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	KHA1	P40309	873 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	TEL2	P53038	688 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	GAD1	Q04792	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	GRC3	Q07845	632 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	GPB1	Q08886	897 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	AIM41	Q12032	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	ECM3	Q99252	613 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	CYC7	P00045	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	TPK1	P06244	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	BIK1	P11709	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	YKL050C	P35736	922 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	CDS1	P38221	457 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	RKM3	P38222	552 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	SFB3	P38810	929 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	VFA1	P40080	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	BST1	P43571	1029 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	IRC6	P43615	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	BSC5	P53755	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	YKU80	Q04437	629 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	HMI1	Q12039	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	NBP2	Q12163	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	TRM11	Q12463	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	SKM1	Q12469	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	SEC12	P11655	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	EMC1	P25574	760 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	PEX5	P35056	612 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	FTR1	P40088	404 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	LYS14	P40971	790 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	POL31	P46957	487 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	RSC1	P53236	928 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	SNO2	P53823	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	VPS64	Q03944	604 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	TAF11	Q04226	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	ADY4	Q05955	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	TGL5	Q12043	749 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	COX17	Q12287	69 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	NPC2	Q12408	173 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	CTT1	P06115	562 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	HOM3	P10869	527 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	OPI1	P21957	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	PEX1	P24004	1043 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	SWI3	P32591	825 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	PXA2	P34230	853 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
CMR3	YPR013C	YJR061W	P40355	935 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	YDL183C	P48569	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	TIM10	P87108	93 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	FCP1	Q03254	732 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	TRS31	Q03337	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	PCD1	Q12524	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	YLR302C	O13544	120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	NPL6	P32832	435 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	CTF13	P35203	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	ESL2	P36168	1195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	YBR225W	P38321	900 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	GET2	P40056	285 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	CTH1	P47976	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	VPS62	P53285	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	FDC1	Q03034	503 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	RXT3	Q07458	294 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	ICL2	Q12031	575 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	TUP1	P16649	713 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	SGF29	P25554	259 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	SWC3	P31376	625 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	DCG1	P32460	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	TOS1	P38288	455 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	MEF2	P39677	819 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	RIP-Chip
CMR3	YPR013C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	SIP4	P46954	829 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	MFB1	Q04922	465 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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