RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	YBR138C	P38277	524 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MSG5	P38590	489 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YIL089W	P40500	205 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MON1	P53129	644 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	HST2	P53686	357 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	VPS16	Q03308	798 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ATG16	Q03818	150 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PPM2	Q08282	695 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YPR204W	Q08995	1032 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SLP1	Q12232	587 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MAS2	P11914	482 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CBS2	P14905	389 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	DAL7	P21826	554 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	DRE2	P36152	348 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SMF2	P38778	549 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SFB3	P38810	929 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	JEM1	P40358	645 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TDA10	P42938	290 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	FMP33	P46998	180 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YNR063W	P53749	607 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TAF11	Q04226	346 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YPT6	Q99260	215 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RPC82	P32349	654 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ASH1	P34233	588 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TOS1	P38288	455 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YGL108C	P53139	140 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ASI3	P53983	676 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	UBP16	Q02863	499 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PGC1	Q08959	321 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	EMP46	Q12396	444 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.39	□□□□□ -1.87	not detected
RRP5	YMR229C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SPS1	P08458	490 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MSS51	P32335	436 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PEP12	P32854	288 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SKT5	P34226	696 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	XDJ1	P39102	459 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SCC4	P40090	624 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ORC3	P54790	616 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CRN1	Q06440	651 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RSC3	Q06639	885 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RAD18	P10862	487 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PDE1	P22434	369 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PHO87	P25360	923 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RAD51	P25454	400 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	KIP2	P28743	706 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	HOG1	P32485	435 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TFB1	P32776	642 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	STV1	P37296	890 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	JHD1	P40034	492 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	STR2	P47164	639 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GCV1	P48015	400 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	USA1	Q03714	838 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	UFO1	Q04511	668 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	DSE3	Q08729	430 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	HRT3	Q12347	344 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SRN2	Q99176	213 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	APM4	Q99186	491 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MDM35	O60200	86 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MIP1	P15801	1254 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MSH2	P25847	964 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GPI10	P30777	616 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	COX13	P32799	129 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PXL1	P36166	706 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YJR061W	P40355	935 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ATG32	P40458	529 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	UFE1	P41834	346 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YNL320W	P42840	284 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GPI1	P53306	609 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87

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