RNA–Protein interactions for RNA: YKR088C

TVP38, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene TVP38, Length 1,014 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TVP38	YKR088C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TVP38	YKR088C	TMT1	P32643	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TVP38	YKR088C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TVP38	YKR088C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
TVP38	YKR088C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TVP38	YKR088C	CAJ1	P39101	391 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TVP38	YKR088C	SEC9	P40357	651 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TVP38	YKR088C	DSN1	P40568	576 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TVP38	YKR088C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TVP38	YKR088C	AMA1	P50082	593 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TVP38	YKR088C	BOP3	P53958	396 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TVP38	YKR088C	TAH18	Q12181	623 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TVP38	YKR088C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TVP38	YKR088C	ADR1	P07248	1323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TVP38	YKR088C	RPO26	P20435	155 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	YHR078W	P38799	552 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	BUD16	P39988	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	NDC80	P40460	691 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	SEC5	P89102	971 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	VPS16	Q03308	798 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	THI7	Q05998	598 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	PRI2	P20457	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	SAP190	P36123	1033 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	YRO2	P38079	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	YBR053C	P38235	358 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	HUL4	P40985	892 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	CWC24	P53769	259 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	ATG23	Q06671	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	ATG9	Q12142	997 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	POM152	P39685	1337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	ADY2	P25613	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	SEC65	P29478	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	YKL069W	P36088	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	VBA5	P36172	582 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	EFM2	P38347	419 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	EFM4	P40516	257 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	MAD1	P40957	749 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	GLO1	P50107	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	PIF1	P07271	859 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	SPO11	P23179	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	DMC1	P25453	334 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	AFR1	P33304	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	YET1	P35723	206 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	YKL133C	P36066	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	VHR1	P40522	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	TPO2	P53283	614 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	VTC3	Q02725	835 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	SHE9	Q04172	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	SVF1	Q05515	481 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	SFH1	Q06168	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	VAC14	Q06708	880 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	RMP1	Q12530	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	RIM15	P43565	1770 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	COQ1	P18900	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	NGG1	P32494	702 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	BCD1	P38772	366 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	CTM1	P38818	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	VPS8	P39702	1274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	MIC19	P43594	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	IRC8	P47046	822 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	YGR237C	P50089	785 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	DAM1	P53267	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	HDA1	P53973	706 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	MMR1	Q06324	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	PIN2	Q12057	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	RRI2	Q12348	645 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	RAD57	P25301	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	HIR1	P32479	840 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	NFU1	P32860	256 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.3 ms