RNA–Protein interactions for RNA: YKL139W

CTK1, Transcript of Catalytic (alpha) subunit of C-terminal domain kinase I (CTDK-I), yeast

Gene CTK1, Length 1,587 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CTK1	YKL139W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	HOS1	Q12214	470 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	DFG16	Q99234	619 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	NUC1	P08466	329 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	POL3	P15436	1097 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	ARG1	P22768	420 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	RER1	P25560	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	YCL049C	P25577	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	XRS2	P33301	854 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	RRN3	P36070	627 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	YLF2	P38746	405 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	SPT20	P50875	604 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	MDR1	P53258	950 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	TRI1	Q05024	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	POM34	Q12445	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	MTF2	P10849	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	CLB4	P24871	460 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	KIN82	P25341	720 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	CDS1	P38221	457 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	RAD26	P40352	1085 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	FKH2	P41813	862 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	BNA1	P47096	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	SPO1	P53541	631 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	ACS1	Q01574	713 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	SIR1	P21691	654 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	SLC1	P33333	303 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	YBR138C	P38277	524 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	LYS9	P38999	446 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	PSF2	P40359	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	TMA108	P40462	946 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	TAH11	P47112	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	MTL1	P53214	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	AAD4	Q07747	329 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	SEC15	P22224	910 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
CTK1	YKL139W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	FTR1	P40088	404 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	AIM21	P40563	679 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	YDL183C	P48569	320 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	THI22	Q06490	572 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	TUP1	P16649	713 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	PEX1	P24004	1043 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	SEG2	P34250	1132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	ERG5	P54781	538 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	CRD1	Q07560	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	AIM41	Q12032	185 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTK1	YKL139W	INH1	P01097	85 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	RIT1	P23796	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	IFA38	P38286	347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	EHT1	P38295	451 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	SFB3	P38810	929 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	NDE1	P40215	560 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	GSM1	P42950	618 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	VID22	Q05934	901 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	PCK1	P10963	549 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	SET3	P36124	751 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	OMA1	P36163	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	COS111	P38308	924 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	FMO1	P38866	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	AXL2	P38928	823 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	YIL077C	P40508	320 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	TFC6	Q06339	672 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	TRM8	Q12009	286 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	LAS17	Q12446	633 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	HOS4	P40480	1083 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	YIR042C	P40586	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	BAP3	P41815	604 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	ECL1	P48235	211 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	TIM50	Q02776	476 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	ARA2	Q04212	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	YFT2	Q06676	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	MED1	Q12321	566 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	RTP1	Q12751	981 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTK1	YKL139W	SAN1	P22470	610 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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