RNA–Protein interactions for RNA: tT(UGU)P

tT(UGU)P, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(UGU)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(UGU)PtT(UGU)P GLE1Q12315 538 aa-0.62□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.62□□□□□ -2.51not detected
tT(UGU)PtT(UGU)P YBL029C-AQ3E756 94 aa-0.62□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P AFI1Q99222 893 aa-0.62□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P YOL085CQ99345 113 aa-0.62□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P HRP1Q99383 534 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P YBT1P32386 1661 aa-0.62□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P URB1P34241 1764 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P POM152P39685 1337 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P HSL1P34244 1518 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P VAR1P02381 398 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P GAL80P04387 435 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P GDH1P07262 454 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P PUT2P07275 575 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P GAL7P08431 366 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P LEU3P08638 886 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P RPL43BP0CX26 92 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P MAK16P10962 306 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P KAR1P11927 433 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P LAT1P12695 482 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P YAK1P14680 807 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P NSP1P14907 823 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P MSD1P15179 658 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P PDX1P16451 410 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P NCP1P16603 691 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P HEM15P16622 393 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P THR1P17423 357 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P PDI1P17967 522 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P PRP5P21372 849 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P REB1P21538 810 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P UBC1P21734 215 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P GRR1P24814 1151 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P AAD3P25612 363 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P YJU2P28320 278 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P LAC1P28496 418 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P HRR25P29295 494 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P SIN4P32259 974 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P AFG1P32317 509 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P SMI1P32566 505 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P LOT5P34234 306 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P SPT23P35210 1082 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P SFK1P35735 353 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P YKL050CP35736 922 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P NNK1P36003 928 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P MID2P36027 376 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.63□□□□□ -2.51not detected
tT(UGU)PtT(UGU)P CUE2P36075 443 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P YBR063CP38083 404 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P TAT1P38085 619 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P RDH54P38086 958 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P PCH2P38126 564 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P TAF5P38129 798 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P EHT1P38295 451 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P ERG7P38604 731 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P PCM1P38628 557 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P YHR020WP38708 688 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P SPC97P38863 823 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P YDR089WP38966 869 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P SHC1P39000 512 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P DUN1P39009 513 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P XDJ1P39102 459 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P PIK1P39104 1066 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P PIC2P40035 300 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data-0.63□□□□□ -2.51not detected
tT(UGU)PtT(UGU)P DDI1P40087 428 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P RTT106P40161 455 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P GID8P40208 455 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P PGD1P40356 397 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P ESL1P40456 1118 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P TED1P40533 473 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P FAF1P40546 346 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.63□□□□□ -2.51not detected
tT(UGU)PtT(UGU)P RTS2P40962 232 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P DIM1P41819 318 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P YCH1P42937 148 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P CCT7P42943 550 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P YFR054CP43622 192 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P ALG2P43636 503 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P PHO86P46956 311 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P YJL144WP47009 104 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P YJR054WP47114 497 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P ACF4P47129 309 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P ABM1P47146 123 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P JHD2P47156 728 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P TRF5P48561 642 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P RTF1P53064 558 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P VID30P53076 958 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P NCS6P53088 359 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P NPY1P53164 384 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P NNF2P53253 936 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P RTS3P53289 263 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P ZPR1P53303 486 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P YGR250CP53316 781 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P CAB4P53332 305 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P YNR014WP53719 212 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P YNR065CP53751 1116 aa-0.63□□□□□ -2.51
tT(UGU)PtT(UGU)P POP3P53833 195 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
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