RNA–Protein interactions for RNA: YLL003W

SFI1, Transcript of Centrin (Cdc31p)-binding protein required for SPB duplication, yeast

Gene SFI1, Length 2,841 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFI1	YLL003W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RAD55	P38953	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YJR061W	P40355	935 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	HUL4	P40985	892 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	PEX8	P53248	589 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YGR111W	P53265	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SFB2	P53953	876 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	FIN1	Q03898	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	GYL1	Q04322	720 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	ARP6	Q12509	438 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	PRD1	P25375	712 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	DAL1	P32375	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	NTH2	P35172	780 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YBR225W	P38321	900 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	VPS8	P39702	1274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SER3	P40054	469 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TED1	P40533	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	STR2	P47164	639 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	KXD1	P53158	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	USA1	Q03714	838 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	VPS64	Q03944	604 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	ARP9	Q05123	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SIR4	P11978	1358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	PMR1	P13586	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SEC63	P14906	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
SFI1	YLL003W	PTP1	P25044	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	GDA1	P32621	518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SLI15	P38283	698 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	FTH1	P38310	465 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	BCD1	P38772	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SUR2	P38992	349 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	IES5	P40060	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YRB2	P40517	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	GYP8	P43570	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YFH7	P43591	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	ISM1	P48526	1002 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YDL183C	P48569	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	FCP1	Q03254	732 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	STE23	Q06010	1027 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	VAC14	Q06708	880 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	GRS2	Q06817	618 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TIP41	Q12199	356 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	BBP1	Q12365	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SET6	Q12529	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	STE3	P06783	470 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	BIK1	P11709	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	URA4	P20051	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	VPS34	P22543	875 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	DYS1	P38791	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RPA14	P50106	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YNR063W	P53749	607 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	FOL1	P53848	824 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	HDA1	P53973	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	COX20	Q04935	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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