RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIR3	YKL163W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	ANP1	P32629	500 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	APE4	P38821	490 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
PIR3	YKL163W	MBP1	P39678	833 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	MPH1	P40562	993 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	ALG2	P43636	503 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	YGL176C	P46945	554 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	YJR096W	P47137	282 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	SGM1	P47166	707 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	SLD3	P53135	668 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	DUS4	Q06063	367 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	GUD1	Q07729	489 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	GRX6	Q12438	231 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	AUS1	Q08409	1394 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	RAD18	P10862	487 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	TOP3	P13099	656 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	BRF1	P29056	596 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	YKL100C	P34248	587 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	MXR1	P40029	184 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	TIM50	Q02776	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	RMT2	Q03305	412 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	RSM24	Q03976	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	TAP42	Q04372	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	HIM1	Q06674	414 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	SVS1	Q12254	260 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	CDC9	P04819	755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	PCL2	P25693	308 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	FUN30	P31380	1131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	DID4	P36108	232 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	YBR284W	P38150	797 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	BIT2	P38346	545 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	CAJ1	P39101	391 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	RAD26	P40352	1085 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	YGL082W	P53155	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
PIR3	YKL163W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	APL1	P27351	700 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	BEM3	P32873	1128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	PET10	P36139	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	MCM7	P38132	845 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	PSY4	P38193	441 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	VPS8	P39702	1274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	CTF4	Q01454	927 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	BLS1	Q06071	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	ADE8	P04161	214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	ENA1	P13587	1091 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	MSH1	P25846	959 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	BCD1	P38772	366 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	QRI7	P43122	407 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	CAF16	P43569	289 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	GPI8	P49018	411 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	NCS6	P53088	359 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	DSD1	P53095	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	NPY1	P53164	384 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	HOL1	P53389	586 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	GTR1	Q00582	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	SDH5	Q08230	162 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	SCM3	Q12334	223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	MSS18	P08593	268 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	PGS1	P25578	521 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	CDC20	P26309	610 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	SPC29	P33419	253 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	PPE1	P38796	400 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	SIT1	P39980	628 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PIR3	YKL163W	RET2	P43621	546 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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