RNA–Protein interactions for RNA: YHR087W

RTC3, Transcript of Protein of unknown function involved in RNA metabolism, yeast

Gene RTC3, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC3	YHR087W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	RPC37	P36121	282 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	FRA1	Q07825	749 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	YPR027C	Q12079	277 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	PCD1	Q12524	340 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	15.88	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	SPO16	P17122	198 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	APM2	P38700	605 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	15.88	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	LAM5	P43560	674 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	YJR054W	P47114	497 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	15.88	■□□□□ 0.13	not detected
RTC3	YHR087W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	15.88	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	JIP3	O13555	125 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	CHS1	P08004	1131 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	PUT4	P15380	627 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	15.87	■□□□□ 0.13	not detected
RTC3	YHR087W	KDX1	P36005	433 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	VHC1	P38329	1120 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	TVP23	P38962	199 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	ARG2	P40360	574 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	YML6	P51998	286 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	MUK1	Q02866	612 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	SWC5	P38326	303 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	15.86	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	15.86	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	TMA108	P40462	946 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	15.86	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	YNL108C	P53929	270 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	15.86	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	TRE1	Q08919	783 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	CTF3	Q12748	733 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	15.85	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	AEP2	P22136	580 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	15.85	■□□□□ 0.13	not detected
RTC3	YHR087W	POP4	P38336	279 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	15.85	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	15.85	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	SHR3	Q02774	210 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	15.85	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	THI7	Q05998	598 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	YDR018C	Q12185	396 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	GCR1	P07261	785 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	VBA3	P25594	458 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	15.84	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	15.84	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	VBA5	P36172	582 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	HLJ1	P48353	224 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	AIM39	Q08223	395 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RTC3	YHR087W	RAD10	P06838	210 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	KAR3	P17119	729 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	OAF3	P36023	863 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	CCL1	P37366	393 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	YBL036C	P38197	257 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	GEM1	P39722	662 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	DSE1	P40077	573 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	SPO74	P45819	413 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	YGR035C	P53222	116 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	PNP1	Q05788	311 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	CDD1	Q06549	142 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	IDI1	P15496	288 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	DEP1	P31385	405 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	UBX7	P38349	436 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	ERP2	P39704	215 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	TRS85	P46944	698 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	URB2	P47108	1174 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	USA1	Q03714	838 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	ARO80	Q04052	950 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	ACM1	Q08981	209 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	15.81	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	RGD2	P43556	714 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	CDC55	Q00362	526 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	15.8	■□□□□ 0.12	not detected
RTC3	YHR087W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	HEM15	P16622	393 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	YCR051W	P25631	222 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	AGP2	P38090	596 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	TBS1	P38114	1094 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	SSP1	P38871	571 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	KHA1	P40309	873 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	YJL045W	P47052	634 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	MSH6	Q03834	1242 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	PRM6	Q04705	352 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	EMP46	Q12396	444 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	VPS5	Q92331	675 aa		15.79	■□□□□ 0.12

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