RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RNQ1	YCL028W	RPC17	P47076	161 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	VPS54	Q12071	889 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	MAC1	P35192	417 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	PFD1	P46988	109 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	URH1	Q04179	340 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	IVY1	Q04934	453 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	ECI1	Q05871	280 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	MDM38	Q08179	573 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	TAF10	Q12030	206 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	APM2	P38700	605 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	YEL023C	P39992	682 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	SPP1	Q03012	353 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	VTI1	Q04338	217 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	ATG23	Q06671	453 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	AIM39	Q08223	395 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	YOR238W	Q08634	303 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	GPM2	Q12008	311 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	LAA1	P39526	2014 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	PUT4	P15380	627 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	CNS1	P33313	385 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	INP52	P50942	1183 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	UFO1	Q04511	668 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	AIM41	Q12032	185 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	YRR1	Q12172	810 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	PRC1	P00729	532 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	PMS1	P14242	873 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	RPO26	P20435	155 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	TKL2	P33315	681 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	SRB2	P34162	210 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	HMT1	P38074	348 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	MSC7	P38694	644 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	NUT1	P53114	1132 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	YNL011C	P53980	444 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	PNG1	Q02890	363 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	YML083C	Q04526	418 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	PRM6	Q04705	352 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	AEP2	P22136	580 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	PEX2	P32800	271 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	GCS1	P35197	352 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	SAK1	P38990	1142 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	KHA1	P40309	873 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	TAF9	Q05027	157 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RNQ1	YCL028W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.71	□□□□□ -0.53	not detected
RNQ1	YCL028W	PDR1	P12383	1068 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	YBR284W	P38150	797 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	SWC5	P38326	303 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	RGD1	P38339	666 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	END3	P39013	349 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	YFL052W	P43551	465 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	SLG1	P54867	378 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	HRT3	Q12347	344 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	RMP1	Q12530	201 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	VPS5	Q92331	675 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	VPS13	Q07878	3144 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	RAD55	P38953	406 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	YIL054W	P40524	105 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	MET13	P53128	600 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	RIM8	P53179	542 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	ADA2	Q02336	434 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	YMR187C	Q03236	431 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	TDA9	Q04545	1251 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	APC5	Q08683	685 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	DDC1	Q08949	612 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	MST1	P07236	462 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	HSL7	P38274	827 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	AVT2	P39981	480 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	SAP185	P40856	1058 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	YML6	P51998	286 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
RNQ1	YCL028W	CDC55	Q00362	526 aa		11.68	□□□□□ -0.54

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