RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeastyeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM10YOL093W TY1A-LR2P0CX72 440 aa5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W TY1A-PLP0CX73 440 aa5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W TY1A-JR1P0CX74 440 aa5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W TY1A-LR3P0CX75 440 aa5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W TY1A-ML2P0CX76 440 aa5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W SAM1P10659 382 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W OM45P16547 393 aa5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W MBR1P23493 339 aa5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W RPC53P25441 422 aa5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W UGA4P32837 571 aa5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W NNK1P36003 928 aa5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W MCR1P36060 302 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W APE3P37302 537 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W EXO5P38289 585 aa5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W PTC7P38797 343 aa5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W FYV10P40492 516 aa5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W RSM26P47141 266 aa5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W ZPR1P53303 486 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W TLG2Q08144 397 aa5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W TY1A-GR1Q12085 440 aa5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W SRD1P09007 221 aa5.36□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W ATE1P16639 503 aa5.36□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W MCM4P30665 933 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W HIR1P32479 840 aa5.36□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W UTR4P32626 227 aa5.36□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W TIM23P32897 222 aa5.36□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W SMY2P32909 740 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W TGL1P34163 548 aa5.36□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W ADE17P38009 592 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W SIP3P38717 1229 aa5.36□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W HMF1P40037 129 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W MDR1P53258 950 aa5.36□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W PGA2P53903 129 aa5.36□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W PHM6Q05637 104 aa5.36□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W MET7Q08645 548 aa5.36□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W WHI5Q12416 295 aa5.36□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W TCP1P12612 559 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W VMA4P22203 233 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W GSY2P27472 705 aa5.35□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W RGT1P32862 1170 aa5.35□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W SAP190P36123 1033 aa5.35□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W HSE1P38753 452 aa5.35□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W NUP82P40368 713 aa5.35□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W THI6P41835 540 aa5.35□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W ULP1Q02724 621 aa5.35□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W TMA64Q04600 565 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W FUS2Q05670 677 aa5.35□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W DUS3Q06053 668 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W CRD1Q07560 283 aa5.35□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W ARP6Q12509 438 aa5.35□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W CDC37P06101 506 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W CLN3P13365 580 aa5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W PFK1P16861 987 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W MSH3P25336 1018 aa5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W SPC110P32380 944 aa5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W TFC4P33339 1025 aa5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W NDT80P38830 627 aa5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W RPN3P40016 523 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W MXR1P40029 184 aa5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W SMC3P47037 1230 aa5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W YGR045CP53229 120 aa5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W ELA1P53861 379 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W ORC4P54791 529 aa5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W ADY4Q05955 493 aa5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W ESC2Q06340 456 aa5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W SMC5Q08204 1093 aa5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W YLL058WQ12198 575 aa5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W RIF1P29539 1916 aa5.34□□□□□ -1.55
TRM10YOL093W PCK1P10963 549 aa5.33□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W TKL1P23254 680 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W RPT1P33299 467 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W ATG19P35193 415 aa5.33□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W PET10P36139 283 aa5.33□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W PPS1P38148 807 aa5.33□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W BCD1P38772 366 aa5.33□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W YAR028WP39548 234 aa5.33□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W GPD2P41911 440 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W COS5P47187 383 aa5.33□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W VID30P53076 958 aa5.33□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W NCS2P53923 493 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W PEX13P80667 386 aa5.33□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W SLD5Q03406 294 aa5.33□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W ADI1Q03677 179 aa5.33□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W MOT1P32333 1867 aa5.32□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W YLR358CO13565 187 aa5.32□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data5.32□□□□□ -1.56not detected
TRM10YOL093W SWI6P09959 803 aa5.32□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W YEL076C-AP0CX16 216 aa5.32□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W YLR464WP0CX17 216 aa5.32□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W DBP5P20449 482 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W CDC48P25694 835 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
TRM10YOL093W SHP1P34223 423 aa5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.1 ms