RNA–Protein interactions for RNA: YMR287C

DSS1, Transcript of 3'-5' exoribonuclease, yeast

Gene DSS1, Length 2,910 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSS1	YMR287C	YAP6	Q03935	383 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	EMC1	P25574	760 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	ECM1	P39715	212 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	BNA1	P47096	177 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	MRPL22	P53881	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	GCN5	Q03330	439 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	LYS9	P38999	446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	GET2	P40056	285 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	EMP65	P40085	556 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	DAS1	P47005	663 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	YHM2	Q04013	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	NPC2	Q12408	173 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	NSI1	Q12457	570 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	POA1	P38218	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	YDL121C	Q07541	149 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
DSS1	YMR287C	PRE4	P30657	266 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	ACA1	P39970	489 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	HIS6	P40545	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	MNT2	P53059	558 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	YLR415C	O13578	112 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	KAR4	P25583	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	DBF20	P32328	564 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	YFL052W	P43551	465 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	VPS36	Q06696	566 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	DFG16	Q99234	619 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	KAR1	P11927	433 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	SAP190	P36123	1033 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	IMA5	P40884	581 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	SPC72	P39723	622 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	HOS4	P40480	1083 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	ERR3	P42222	437 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	PEF1	P53238	335 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	YNR071C	P53757	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	ADH4	P10127	382 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	YNL195C	P40168	261 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	BIT61	P47041	543 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	SNO2	P53823	222 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	GPB1	Q08886	897 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	MCM21	Q06675	368 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	TGL5	Q12043	749 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	NKP1	Q12493	238 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	PET127	P32606	800 aa		4.51	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	YBR053C	P38235	358 aa		4.51	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	RPP1	P38786	293 aa		4.51	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	TRM13	Q12383	476 aa		4.51	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	SOD2	P00447	233 aa		4.51	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	PLB1	P39105	664 aa		4.51	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.51	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	SED4	P25365	1065 aa		4.5	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	UBS1	P38290	277 aa		4.5	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	STL1	P39932	569 aa		4.5	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	PUS2	P53167	370 aa		4.5	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	THI22	Q06490	572 aa		4.5	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	YPL277C	Q08989	487 aa		4.5	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	NYV1	Q12255	253 aa		4.5	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	TRM11	Q12463	433 aa		4.5	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.5	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.5	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	DCG1	P32460	244 aa		4.5	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	YKL133C	P36066	463 aa		4.5	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.5	□□□□□ -1.69	RIP-Chip
DSS1	YMR287C	YEL076C	P39971	216 aa		4.5	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	NSE5	Q03718	556 aa		4.5	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	SEG2	P34250	1132 aa		4.49	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	SWD1	P39706	426 aa		4.49	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	VPS30	Q02948	557 aa		4.49	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	ARP7	Q12406	477 aa		4.49	□□□□□ -1.69
DSS1	YMR287C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69

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