RNA–Protein interactions for RNA: YMR198W

CIK1, Transcript of Kinesin-associated protein, yeast

Gene CIK1, Length 1,785 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIK1	YMR198W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	MDM12	Q92328	271 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	LYS9	P38999	446 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	ECM1	P39715	212 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	TEL2	P53038	688 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	YHR112C	P38716	378 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	ATF1	P40353	525 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	MTL1	P53214	551 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	BNA2	P47125	453 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	GAD1	Q04792	585 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	SIR3	P06701	978 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	FMO1	P38866	432 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	YKR051W	P36142	418 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	TDP1	P38319	544 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	CAF16	P43569	289 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	UBS1	P38290	277 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
CIK1	YMR198W	NUP82	P40368	713 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	VBA3	P25594	458 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	TAH11	P47112	604 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	BNR1	P40450	1375 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	YBP2	P53169	641 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	ARP4	P80428	489 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
CIK1	YMR198W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	SSL2	Q00578	843 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	SRD1	P09007	221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	SFB3	P38810	929 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	GET2	P40056	285 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	YFL052W	P43551	465 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	NPY1	P53164	384 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	MCM21	Q06675	368 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	KIN3	P22209	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	FLO10	P36170	1169 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	DSS1	P39112	969 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	NUP60	P39705	539 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	FHN1	P53279	174 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	TAF3	Q12297	353 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	PHO8	P11491	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	ORC4	P54791	529 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	CIT2	P08679	460 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	MSH2	P25847	964 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	YKR018C	P36114	725 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	REV7	P38927	245 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	GID8	P40208	455 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	YAP1802	P53309	568 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	HOG1	P32485	435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	PEX2	P32800	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	EMP70	P32802	667 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	PHO11	P35842	467 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	PHO12	P38693	467 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	YJL206C	P39529	758 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	PCL10	P53124	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	NHX1	Q04121	633 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	NDC80	P40460	691 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	MLH3	Q12083	715 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	GSY1	P23337	708 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	PPZ2	P33329	710 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	HSL7	P38274	827 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	RAD18	P10862	487 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	CDC43	P18898	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	PCL2	P25693	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIK1	YMR198W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CIK1	YMR198W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CIK1	YMR198W	ADY2	P25613	283 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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