RNA–Protein interactions for RNA: YGR104C

SRB5, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene SRB5, Length 924 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRB5	YGR104C	RXT2	P38255	430 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	SDP1	P40479	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	STU2	P46675	888 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	BDF2	Q07442	638 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	MCH5	Q08777	521 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	INO80	P53115	1489 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	PET111	P08468	800 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	PRI2	P20457	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	NPP1	P25353	742 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	PEX5	P35056	612 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	YKL069W	P36088	180 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	SRB7	P47822	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	YGR016W	P53209	190 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	RIA1	P53893	1110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	VTC3	Q02725	835 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	PEX19	Q07418	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	SWM1	Q12379	170 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	AFR1	P33304	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	REC104	P33323	182 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	RRN3	P36070	627 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	CTF8	P38877	133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	CAJ1	P39101	391 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	DAS1	P47005	663 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	HOL1	P53389	586 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	TRM11	Q12463	433 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	ATP4	P05626	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	PIF1	P07271	859 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	MET3	P08536	511 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	PEX6	P33760	1030 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	NUP82	P40368	713 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	RSC1	P53236	928 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	MEF1	P25039	761 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	AAD3	P25612	363 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	CTF13	P35203	478 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	ESL2	P36168	1195 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	KEL2	P50090	882 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	SPO75	Q07798	868 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	NYV1	Q12255	253 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	ALG7	P07286	448 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	NGG1	P32494	702 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	MAM1	P40065	302 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	AIM20	P40451	204 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	ERG5	P54781	538 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	YML122C	Q03207	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	SPC19	Q03954	165 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	DLT1	Q04216	342 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	APN1	P22936	367 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	HIR1	P32479	840 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	YBR184W	P38299	523 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	NDE1	P40215	560 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	TOK1	P40310	691 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	VPS4	P52917	437 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	BTN2	P53286	410 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
SRB5	YGR104C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	ERO1	Q03103	563 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	MSH2	P25847	964 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	SSH4	P32343	579 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	IME2	P32581	645 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	NIP100	P33420	868 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	YHR078W	P38799	552 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	CEP3	P40969	608 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SRB5	YGR104C	PFD1	P46988	109 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 69.8 ms