RNA–Protein interactions for RNA: Q0297

Q0297, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0297, Length 156 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0297	Q0297	PEX1	P24004	1043 aa		18.66	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	AGP2	P38090	596 aa		18.66	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	18.66	■□□□□ 0.58	not detected
Q0297	Q0297	WAR1	Q03631	944 aa		18.66	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	YPR027C	Q12079	277 aa		18.66	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	DAP1	Q12091	152 aa		18.66	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	EFM2	P38347	419 aa		18.65	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	CDC42	P19073	191 aa		18.64	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	MSH3	P25336	1018 aa		18.64	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	PGS1	P25578	521 aa		18.64	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	18.64	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	COQ8	P27697	501 aa		18.63	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	RDH54	P38086	958 aa		18.63	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	CHS1	P08004	1131 aa		18.62	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	SLA2	P33338	968 aa		18.62	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	SAP190	P36123	1033 aa		18.62	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	YBR284W	P38150	797 aa		18.62	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	RGD1	P38339	666 aa		18.62	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	GEM1	P39722	662 aa		18.62	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	ADA2	Q02336	434 aa		18.62	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	CDC11	P32458	415 aa		18.61	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	XRS2	P33301	854 aa		18.61	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	RSC1	P53236	928 aa		18.61	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	TAF10	Q12030	206 aa		18.61	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	RKM3	P38222	552 aa		18.6	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	APM4	Q99186	491 aa		18.6	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	TPK1	P06244	397 aa		18.59	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	SPE1	P08432	466 aa		18.59	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	SPO11	P23179	398 aa		18.59	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	KIP1	P28742	1111 aa		18.59	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	NIP100	P33420	868 aa		18.59	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	LEO1	P38439	464 aa		18.59	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	MUB1	Q03162	620 aa		18.59	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	PPM1	Q04081	328 aa		18.59	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
Q0297	Q0297	PDE1	P22434	369 aa		18.58	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	GAC1	P28006	793 aa		18.58	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	SEC65	P29478	273 aa		18.58	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	KDX1	P36005	433 aa		18.58	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	PEX28	P38848	579 aa		18.58	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	TAF1	P46677	1066 aa		18.58	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	YJR054W	P47114	497 aa		18.58	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	HRT3	Q12347	344 aa		18.58	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	ECM3	Q99252	613 aa		18.58	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	FRE1	P32791	686 aa		18.57	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	TGL3	P40308	642 aa		18.57	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	MOB1	P40484	314 aa		18.57	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	DAL2	P25335	343 aa		18.56	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	MRPL10	P36520	322 aa		18.56	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		18.56	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	SMC1	P32908	1225 aa		18.55	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	PRM6	Q04705	352 aa		18.55	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	CSG2	P35206	410 aa		18.54	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	YPR078C	Q06813	372 aa		18.54	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	GPM2	Q12008	311 aa		18.54	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	APE1	P14904	514 aa		18.53	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	SCJ1	P25303	377 aa		18.53	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	SAF1	P38352	637 aa		18.53	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	ZAP1	P47043	880 aa		18.53	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	YJL045W	P47052	634 aa		18.53	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	VBA3	P25594	458 aa		18.52	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	TKL2	P33315	681 aa		18.52	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	VBA5	P36172	582 aa		18.52	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	VPS25	P47142	202 aa		18.52	■□□□□ 0.56
Q0297	Q0297	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	18.52	■□□□□ 0.56	not detected
Q0297	Q0297	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	PEP7	P32609	515 aa		18.51	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	YBR056W	P38081	501 aa		18.51	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	SDS3	P40505	327 aa		18.51	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	BFA1	P47113	574 aa		18.51	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	HFM1	P51979	1187 aa		18.51	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	YPR148C	Q06523	435 aa		18.51	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	HMG2	P12684	1045 aa		18.5	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	DSE1	P40077	573 aa		18.5	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	ESBP6	P53918	673 aa		18.5	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	YLR287C	Q05881	355 aa		18.5	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	SGO1	Q08490	590 aa		18.5	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	RRD2	Q12461	358 aa		18.5	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	SIF2	P38262	535 aa		18.49	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.3 ms