RNA–Protein interactions for RNA: YOR328W

PDR10, Transcript of ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene PDR10, Length 4,695 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDR10	YOR328W	HFI1	Q12060	488 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	SWI3	P32591	825 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	UGA4	P32837	571 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	ROG3	P43602	733 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	CIT2	P08679	460 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	PSY4	P38193	441 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	PSY2	P40164	858 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	SNA3	P14359	133 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	VPS3	P23643	1011 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	TRK2	P28584	889 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	VTC3	Q02725	835 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	SPO12	P17123	173 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	PRR1	P28708	518 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	LAM5	P43560	674 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	YGR130C	P53278	816 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	REC8	Q12188	680 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	ZPS1	Q12512	249 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	FLO1	P32768	1537 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	POX1	P13711	748 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	COT1	P32798	439 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	UBP11	P36026	717 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	BCD1	P38772	366 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	SEC9	P40357	651 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	NUP82	P40368	713 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	FLR1	P38124	548 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	EFM2	P38347	419 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	STU2	P46675	888 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	DSL1	P53847	754 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	AFT1	P22149	690 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	DPB3	P27344	201 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	GUD1	Q07729	489 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	OSH2	Q12451	1283 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	SEM1	O94742	89 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	SPC72	P39723	622 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	MXR1	P40029	184 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	BRE2	P43132	505 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	HOP2	P53187	214 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	VPS62	P53285	467 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	ESC8	Q08119	714 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	YSC83	P32792	385 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	VPS29	P38759	282 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	PEX15	Q08215	383 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	YUR1	P26725	428 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	MMM1	P41800	426 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	GYL1	Q04322	720 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	TAO3	P40468	2376 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	CLB1	P24868	471 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	CSE2	P33308	149 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	TRM2	P33753	639 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	SWD1	P39706	426 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	SOV1	Q04748	898 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	COG4	Q06096	861 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	ICL2	Q12031	575 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	IOC2	Q12072	812 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	ARP7	Q12406	477 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	RAD54	P32863	898 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	MMS4	P38257	691 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	STB4	P50104	949 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	SHE10	P53075	577 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	ULP1	Q02724	621 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	YLR297W	Q05899	129 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	TAF10	Q12030	206 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	FUB1	P25659	250 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	XDJ1	P39102	459 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	YNL146W	P53906	100 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	YNL115C	P53925	644 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PDR10	YOR328W	RKM2	Q03942	479 aa		5.17	□□□□□ -1.58

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