RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	ERP6	P53198	216 aa		2.5	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	YKR011C	Q02209	353 aa		2.5	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	2.5	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	2.5	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	YPR196W	Q06595	470 aa		2.5	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	SPO75	Q07798	868 aa		2.5	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	2.5	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	RPN13	O13563	156 aa		2.49	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	MPH2	P0CD99	609 aa		2.49	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	PTP1	P25044	335 aa		2.49	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	YRO2	P38079	344 aa		2.49	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	YBR184W	P38299	523 aa		2.49	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	VAC8	P39968	578 aa		2.49	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	ATG11	Q12527	1178 aa		2.49	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	2.48	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	NGG1	P32494	702 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	EMC3	P36039	253 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	YHR078W	P38799	552 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	MEP2	P41948	499 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	YJL163C	P46996	555 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	AMA1	P50082	593 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	ASI2	P53895	289 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	2.48	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	CRR1	Q05790	422 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	SWM1	Q12379	170 aa		2.48	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	ECM1	P39715	212 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	NET1	P47035	1189 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	MUP1	P50276	574 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	ATP25	Q03153	612 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	CIR2	Q08822	631 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	ENV7	Q12003	364 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	HBN1	Q96VH4	193 aa		2.47	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	PRI2	P20457	528 aa		2.46	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	YEL020C	P39994	560 aa		2.46	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	ALR2	P43553	858 aa		2.46	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	NIT3	P49954	291 aa		2.46	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	2.46	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	EAF1	Q06337	982 aa		2.46	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	REH1	Q06709	432 aa		2.46	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	THI21	Q08975	551 aa		2.46	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	CIT1	P00890	479 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	2.45	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	2.45	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	VPS34	P22543	875 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	SIC1	P38634	284 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	RPP1	P38786	293 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	YJL206C	P39529	758 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	FKH2	P41813	862 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	BAP3	P41815	604 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	2.45	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	SSL2	Q00578	843 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	TAF8	Q03750	510 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	SGO1	Q08490	590 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	OSH2	Q12451	1283 aa		2.45	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	YLR415C	O13578	112 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	2.44	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	2.44	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	2.44	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	YBR053C	P38235	358 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	YBR259W	P38338	688 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	2.44	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	PZF1	P39933	429 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	2.44	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	YIR042C	P40586	236 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	2.44	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	TAF3	Q12297	353 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	YPR071W	Q12346	211 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	GPR1	Q12361	961 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	YLR149C	Q99296	730 aa		2.44	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	2.43	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	SIR3	P06701	978 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	RPD3	P32561	433 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	EMP70	P32802	667 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	2.43	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	CEP3	P40969	608 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	HUL4	P40985	892 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	2.43	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	YAP1802	P53309	568 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	PKH1	Q03407	766 aa		2.43	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	2.43	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	ARE1	P25628	610 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	2.42	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	VHR1	P40522	640 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	ALG2	P43636	503 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	HXT16	P47185	567 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	2.42	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	2.42	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	2.42	□□□□□ -2.02

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