RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN11	YML043C	RTS1	P38903	757 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	PES4	P39684	611 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	NUP60	P39705	539 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	YGL242C	P53066	181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	TAF8	Q03750	510 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	TOS4	Q06266	489 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	DNF1	P32660	1571 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SPE2	P21182	396 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	STE11	P23561	717 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	TAT1	P38085	619 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	RAD55	P38953	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	FAA3	P39002	694 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	MEP1	P40260	492 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	ALG2	P43636	503 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	NPA3	P47122	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	ESBP6	P53918	673 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	COG4	Q06096	861 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	ATG9	Q12142	997 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	HIS3	P06633	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	TFC3	P34111	1160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	MSC7	P38694	644 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	FTR1	P40088	404 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	RSM25	P40496	264 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	STB1	P42845	420 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	ILM1	P47155	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SHE10	P53075	577 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	ALG12	P53730	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SEC5	P89102	971 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SNZ1	Q03148	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	RPN4	Q03465	531 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	ECM11	Q04110	302 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	YKU80	Q04437	629 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	FAR8	Q05040	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	NNT1	Q05874	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	PMR1	P13586	950 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	HSP78	P33416	811 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	ATG19	P35193	415 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	DYS1	P38791	387 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	YHR218W	P38899	603 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SPT8	P38915	602 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SWD1	P39706	426 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	FIR1	P40020	876 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	NTA1	P40354	457 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	LAM5	P43560	674 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	RAD17	P48581	401 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SSL2	Q00578	843 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	MFM1	Q02783	413 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	DAL4	Q04895	635 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	OMS1	Q06668	471 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	PSK1	P31374	1356 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	KCC4	P25389	1037 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	PLC1	P32383	869 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	RIB7	P33312	244 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	ESL2	P36168	1195 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	MRPL40	P36534	297 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	YBR242W	P38331	238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	YHL008C	P38750	627 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
RRN11	YML043C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	TMN3	P40071	706 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	GCD10	P41814	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	MRPS18	P42847	217 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	PRY1	P47032	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	VPS53	P47061	822 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	SGM1	P47166	707 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	MTO1	P53070	669 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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