RNA–Protein interactions for RNA: YKL143W

LTV1, Transcript of Component of the GSE complex, yeast

Gene LTV1, Length 1,392 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LTV1	YKL143W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	CNN1	P43618	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	VPS53	P47061	822 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	FIG2	P25653	1609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	YKL069W	P36088	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	MAM1	P40065	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	NNF1	P47149	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	ALT1	P52893	592 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	FCP1	Q03254	732 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	IOC4	Q04213	475 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	SPO20	Q04359	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	GRX6	Q12438	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	INO1	P11986	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	MLS1	P30952	554 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	PRO1	P32264	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	MCM7	P38132	845 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	EAR1	Q03212	550 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	ESC2	Q06340	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	SWI1	P09547	1314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
LTV1	YKL143W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	RGD1	P38339	666 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	MPH1	P40562	993 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	GYP7	P48365	746 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	TPP1	Q03796	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	KIP1	P28742	1111 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	GPB2	P39717	880 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	YJL045W	P47052	634 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	YVC1	Q12324	675 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	OCA5	P38738	679 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	PEX7	P39108	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	YGL176C	P46945	554 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	HNT2	P49775	206 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	MRPL22	P53881	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	SRT1	Q03175	343 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	PKH1	Q03407	766 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	YDL144C	Q07589	356 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	SPO21	Q12411	609 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	RKM4	Q12504	494 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	MSM1	P22438	575 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	AGP1	P25376	633 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	YKL107W	P34251	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	STV1	P37296	890 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	YJR008W	P47085	338 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	RIM8	P53179	542 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	DNM1	P54861	757 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	YER152C	P10356	443 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	MRP7	P12687	371 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	KRE2	P27809	442 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	NUP133	P36161	1157 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	VBA5	P36172	582 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	PTC7	P38797	343 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	SPL2	P38839	148 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	VPS4	P52917	437 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	GNT1	Q12096	491 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	FLO11	P08640	1367 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	TAT2	P38967	592 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	YIL089W	P40500	205 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	YJL049W	P47048	450 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	TIM50	Q02776	476 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	SHE9	Q04172	456 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	SWC3	P31376	625 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	MGM1	P32266	881 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	YSC84	P32793	468 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
LTV1	YKL143W	YBR184W	P38299	523 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	GTS1	P40956	396 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	GSM1	P42950	618 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	YGR117C	P53270	476 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LTV1	YKL143W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.8 ms