RNA–Protein interactions for RNA: YJR005C-A

LSO1, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene LSO1, Length 282 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LSO1	YJR005C-A	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	YML037C	Q03703	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	SVF1	Q05515	481 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	YAP7	Q08182	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	APL4	Q12028	832 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	GIN4	Q12263	1142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	PHO13	P19881	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	TBS1	P38114	1094 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	ISW1	P38144	1129 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	PIH1	P38768	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	CAJ1	P39101	391 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
LSO1	YJR005C-A	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	YLR287C	Q05881	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	SFI1	Q12369	946 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	CSR2	Q12734	1121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	FOB1	O13329	566 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	OCT1	P35999	772 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	YKR018C	P36114	725 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	THI6	P41835	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	SMC3	P47037	1230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	GUP1	P53154	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	VPS60	Q03390	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	VPS38	Q05919	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	TDA6	Q06466	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	SPO75	Q07798	868 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	SRD1	P09007	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	MTF2	P10849	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	RAD18	P10862	487 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	RPC53	P25441	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	MCD4	P36051	919 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	YEL076C	P39971	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	BIM1	P40013	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	ATG3	P40344	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	YFL034W	P43564	1073 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	LIF1	P53150	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	SEC5	P89102	971 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	HMI1	Q12039	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	ATG9	Q12142	997 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	SPO11	P23179	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	PER1	P25625	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	XRS2	P33301	854 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	NIP100	P33420	868 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	PCH2	P38126	564 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	YBL036C	P38197	257 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	EFM2	P38347	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	VAB2	P40003	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	VFA1	P40080	203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	PEA2	P40091	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	YNR014W	P53719	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	TOF1	P53840	1238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	ORC4	P54791	529 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	UME1	Q03010	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	YMR187C	Q03236	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	COG4	Q06096	861 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	OPY2	Q06810	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	ARP6	Q12509	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	FBP1	P09201	348 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	SWI6	P09959	803 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	CLN3	P13365	580 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	APL1	P27351	700 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	SUV3	P32580	737 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	UGA4	P32837	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	CAB3	P36076	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LSO1	YJR005C-A	TCD1	P38756	429 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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