RNA–Protein interactions for RNA: YHR010W

RPL27A, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L27A, yeast

Gene RPL27A, Length 411 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL27A	YHR010W	RPD3	P32561	433 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	SCT1	P32784	759 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	VPS30	Q02948	557 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	RAD4	P14736	754 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	PET10	P36139	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	HDA1	P53973	706 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	ARE1	P25628	610 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	CTF8	P38877	133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	SDP1	P40479	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	TOP3	P13099	656 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
RPL27A	YHR010W	ENV7	Q12003	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	CEP3	P40969	608 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	YJL049W	P47048	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	ERG5	P54781	538 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	CIT1	P00890	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	TIM54	P47045	478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	RAD53	P22216	821 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	ERG4	P25340	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	KTR4	P38131	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	TAF8	Q03750	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	PEX19	Q07418	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
RPL27A	YHR010W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	FLC1	Q08967	793 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	OAR1	P35731	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	YHR078W	P38799	552 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	CTF13	P35203	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	EMC3	P36039	253 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	BET3	P36149	193 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	MOH1	P38191	138 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	SUL1	P38359	859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	HUL4	P40985	892 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	HUL5	P53119	910 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	SWM1	Q12379	170 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	TRM13	Q12383	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	TRM11	Q12463	433 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	GYP8	P43570	497 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	NIT3	P49954	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	PUS2	P53167	370 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	PPM2	Q08282	695 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL27A	YHR010W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	RNT1	Q02555	471 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	BDF2	Q07442	638 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	CAN1	P04817	590 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	DAL7	P21826	554 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	RTA1	P53047	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	TAD1	P53065	400 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	ASI2	P53895	289 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	GIS1	Q03833	894 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	ALG7	P07286	448 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	RPP1	P38786	293 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	VHR1	P40522	640 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	DAM1	P53267	343 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	MRPS35	P53292	345 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	OMS1	Q06668	471 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	YCL002C	P25565	263 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	ALG2	P43636	503 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	DLT1	Q04216	342 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	NSE3	Q05541	303 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	MET3	P08536	511 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	ELO3	P40319	345 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	ATP25	Q03153	612 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL27A	YHR010W	REH1	Q06709	432 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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