RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W HSM3P38348 480 aa13.54□□□□□ -0.24
SSA4YER103W TIF5P38431 405 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SSA4YER103W PTP3P40048 928 aa13.54□□□□□ -0.24
SSA4YER103W ASE1P50275 885 aa13.54□□□□□ -0.24
SSA4YER103W ATG1P53104 897 aa13.54□□□□□ -0.24
SSA4YER103W MYO1P08964 1928 aa13.54□□□□□ -0.24
SSA4YER103W TRP2P00899 507 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SSA4YER103W RPC37P36121 282 aa13.54□□□□□ -0.24
SSA4YER103W YMR018WQ04364 514 aa13.54□□□□□ -0.24
SSA4YER103W MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data13.54□□□□□ -0.24not detected
SSA4YER103W ACM1Q08981 209 aa13.54□□□□□ -0.24
SSA4YER103W HIF1Q12373 385 aa13.54□□□□□ -0.24
SSA4YER103W YLR462WO13556 202 aa13.53□□□□□ -0.24
SSA4YER103W SPS22P25380 463 aa13.53□□□□□ -0.24
SSA4YER103W PTC3P34221 468 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SSA4YER103W YBR032WP38223 100 aa13.53□□□□□ -0.24
SSA4YER103W YHL049CP38722 271 aa13.53□□□□□ -0.24
SSA4YER103W YEL075CP39972 122 aa13.53□□□□□ -0.24
SSA4YER103W YER189WP40104 122 aa13.53□□□□□ -0.24
SSA4YER103W YFL064CP43540 174 aa13.53□□□□□ -0.24
SSA4YER103W YBL111CQ3E7Y5 667 aa13.53□□□□□ -0.24
SSA4YER103W PEP5P12868 1029 aa13.52□□□□□ -0.24
SSA4YER103W BLI1P35727 113 aa13.52□□□□□ -0.24
SSA4YER103W BIM1P40013 344 aa13.52□□□□□ -0.24
SSA4YER103W ATG32P40458 529 aa13.52□□□□□ -0.24
SSA4YER103W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
SSA4YER103W YPR097WQ06839 1073 aa13.52□□□□□ -0.24
SSA4YER103W MET7Q08645 548 aa13.52□□□□□ -0.24
SSA4YER103W RPL24AP04449 155 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SSA4YER103W MGM1P32266 881 aa13.52□□□□□ -0.25
SSA4YER103W BCH2P36122 765 aa13.52□□□□□ -0.25
SSA4YER103W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data13.52□□□□□ -0.25not detected
SSA4YER103W NUP60P39705 539 aa13.52□□□□□ -0.25
SSA4YER103W ALG5P40350 334 aa13.52□□□□□ -0.25
SSA4YER103W HXT8P40886 569 aa13.52□□□□□ -0.25
SSA4YER103W EMP47P43555 445 aa13.52□□□□□ -0.25
SSA4YER103W ZIP2P53061 704 aa13.52□□□□□ -0.25
SSA4YER103W SHE10P53075 577 aa13.52□□□□□ -0.25
SSA4YER103W COS6P53344 381 aa13.52□□□□□ -0.25
SSA4YER103W DSE4P53753 1117 aa13.52□□□□□ -0.25
SSA4YER103W JJJ1P53863 590 aa13.52□□□□□ -0.25
SSA4YER103W ASI1P54074 624 aa13.52□□□□□ -0.25
SSA4YER103W SHR3Q02774 210 aa13.52□□□□□ -0.25
SSA4YER103W CKA2P19454 339 aa13.51□□□□□ -0.25
SSA4YER103W MMS21P38632 267 aa13.51□□□□□ -0.25
SSA4YER103W APL6P46682 809 aa13.51□□□□□ -0.25
SSA4YER103W CBK1P53894 756 aa13.51□□□□□ -0.25
SSA4YER103W IOC2Q12072 812 aa13.51□□□□□ -0.25
SSA4YER103W TOA1P32773 286 aa13.51□□□□□ -0.25
SSA4YER103W KTR2P33550 425 aa13.51□□□□□ -0.25
SSA4YER103W RFC3P38629 340 aa13.51□□□□□ -0.25
SSA4YER103W SPR3P41901 512 aa13.51□□□□□ -0.25
SSA4YER103W ILV2P07342 687 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
SSA4YER103W SPO16P17122 198 aa13.5□□□□□ -0.25
SSA4YER103W CDC48P25694 835 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
SSA4YER103W RPC82P32349 654 aa13.5□□□□□ -0.25
SSA4YER103W PPS1P38148 807 aa13.5□□□□□ -0.25
SSA4YER103W SSP1P38871 571 aa13.5□□□□□ -0.25
SSA4YER103W RSC8P43609 557 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
SSA4YER103W HPC2Q01448 625 aa13.5□□□□□ -0.25
SSA4YER103W YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SSA4YER103W RAD61Q99359 647 aa13.5□□□□□ -0.25
SSA4YER103W ADE3P07245 946 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W YEL076C-AP0CX16 216 aa13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W YLR464WP0CX17 216 aa13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W GPI10P30777 616 aa13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W MRE11P32829 692 aa13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W SAS3P34218 831 aa13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W YKL050CP35736 922 aa13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W YEL076CP39971 216 aa13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W JEM1P40358 645 aa13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W SDS3P40505 327 aa13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W CIT3P43635 486 aa13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W HOP2P53187 214 aa13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W IST1P53843 298 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W UBP2Q01476 1272 aa13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W EUG1P32474 517 aa13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W PRP40P33203 583 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W CCT3P39077 534 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W ALD6P54115 500 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W RPL22BP56628 122 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SSA4YER103W PRT1P06103 763 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SSA4YER103W ADE2P21264 571 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SSA4YER103W VPH2P32341 215 aa13.48□□□□□ -0.25
SSA4YER103W CDC3P32457 520 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SSA4YER103W NPL6P32832 435 aa13.48□□□□□ -0.25
SSA4YER103W PTK1P36002 662 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
SSA4YER103W AMN1P38285 549 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
SSA4YER103W TAF6P53040 516 aa13.48□□□□□ -0.25
SSA4YER103W DSE3Q08729 430 aa13.48□□□□□ -0.25
SSA4YER103W YPT6Q99260 215 aa13.48□□□□□ -0.25
SSA4YER103W SEC20P28791 383 aa13.47□□□□□ -0.25
SSA4YER103W TFC4P33339 1025 aa13.47□□□□□ -0.25
SSA4YER103W KRE28Q04431 385 aa13.47□□□□□ -0.25
SSA4YER103W TDA5Q06417 326 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
SSA4YER103W TCO89Q08921 799 aa13.47□□□□□ -0.25
SSA4YER103W RUP1Q12242 671 aa13.47□□□□□ -0.25
SSA4YER103W SLA2P33338 968 aa13.47□□□□□ -0.25
SSA4YER103W HIS2P38635 335 aa13.47□□□□□ -0.25
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